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【東京都】医療機関向け電子処方箋導入補助金|最大100万円超!令和7年度の申請方法を解説

約16分で読了 89回閲覧 2025年11月30日最新情報
補助金額
最大100万円
補助率 施設規模により補助率が異なります。 ・大規模病院(病床数200床以上)および病院:補助対象経費の6分の1 ・診療所:補助対象経費の4分の1
申請締切
残り18日
2025年12月26日
難易度
普通
採択率
30.0%

補助金詳細

Details
金額・補助率
補助金額
最大100万円
補助率
施設規模により補助率が異なります。 ・大規模病院(病床数200床以上)および病院:補助対象経費の6分の1 ・診療所:補助対象経費の4分の1
スケジュール
申請締切
2025年12月26日 (残り18日)
対象要件
主催機関
東京都
対象地域
対象者

都内に開設する医療機関(健康保険法第63条第3項各号に定める病院又は診療所)。ただし、都が開設している病院及び診療所を除く。

申請要件
必要書類

Jグランツでの電子申請となります。申請にはGビズIDプライムアカウントが必要です。また、申請の前提条件として、社会保険診療報酬支払基金からの補助金交付決定通知書が必要となります。その他、Jグランツ上で指定される申請様式や経費の内訳がわかる書類(見積書等)の提出が求められる可能性があります。詳細は公募開始後に発表される要綱をご確認ください。

対象経費

補助対象経費は以下の通りです。
1. 電子処方箋管理サービスの初期導入費用:レセプトコンピューター及び電子カルテシステム等の既存システムの改修費、導入に付随する職員への実施指導等の費用。
2. 新機能の導入費用:「リフィル処方箋」「口頭同意による重複投薬等チェック結果の閲覧」「マイナンバーカード署名」「処方箋ID検索」に関する機能の導入費用。

申請前チェックリスト

0 / 6 完了 0%
申請資格
対象者の要件を満たしている 必須
都内に開設する医療機関(健康保険法第63条第3項各号に定める病院又は診療所)。ただし、都が開設している病院及び診療所を除く。
事業者区分、業種、従業員数などの要件を確認してください。
対象地域に該当する 必須
対象: 東京都
事業所の所在地が対象地域内にあることを確認してください。
対象経費に該当する事業である 必須
補助対象経費は以下の通りです。 1. 電子処方箋管理サービスの初期導入費用:レセプトコンピューター及び電子カルテシステム等の既存システムの改修費、導入に付随する職員への実施指導等の費用。 2. 新機能の導入費用:「リフィル処方箋」「口頭同意による重複投薬等チェック結果の閲覧」「マイナンバーカード署名」「処方箋ID検索」に関する機能の導入費用。
補助対象となる経費の種類を確認してください。
スケジュール
申請期限内である 必須
締切: 2025年12月26日
申請書類の準備期間も考慮して、余裕を持って申請してください。
書類準備
事業計画書を作成できる 必須
補助事業の目的、内容、効果を明確に記載した計画書が必要です。
必要書類を準備できる 必須
Jグランツでの電子申請となります。申請にはGビズIDプライムアカウントが必要です。また、申請の前提条件として、社会保険診療報酬支払基金からの補助金交付決定通知書が必要となります。その他、Jグランツ上で指定される申請様式や経費の内訳がわかる書類(見積書等)の提出が求められる可能性があります。詳細は公募開始後に発表される要綱をご確認ください。
決算書、登記簿謄本、納税証明書などが必要になることが多いです。
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です

補助金概要

Overview

この記事の信頼性
監修:補助金インサイト編集部(中小企業診断士・行政書士監修)
最終更新:2025年1月15日
情報源:東京都医療機関・薬局における電子処方箋の活用・普及の促進事業 公募情報

📋
基本情報サマリー
制度名 医療機関における電子処方箋の活用・普及の促進事業
最大補助額 最大100万3,000円
補助率 1/6 または 1/4
対象エリア 東京都内の医療機関
主な対象経費 電子処方箋システム導入、新機能改修費など
申請期限 令和7年12月26日(金)まで

東京都では、医療DXの推進を加速させるため、都内の医療機関を対象とした独自の支援制度「医療機関における電子処方箋の活用・普及の促進事業」を実施します。本事業は、国の補助金に上乗せする形で支給されるため、システム導入にかかる自己負担を大幅に軽減できるチャンスです。

特に注目すべきは、最大で100万円を超える補助額と、令和7年度限りの実施という点です。本記事では、申請支援のプロフェッショナルの視点から、複雑な要件を整理し、確実に受給するためのポイントを解説します。

この補助金を30秒で理解

この補助金は、電子処方箋システムの導入に取り組む東京都内の病院・診療所を支援する制度です。最も重要な特徴は、国の補助金(社会保険診療報酬支払基金)との併用が前提となっている点です。

💡
重要ポイント
  • 国の補助金に上乗せ:都独自の支援で負担をさらに軽減。
  • 交付決定が必須:申請時点で国の補助金の交付決定を受けている必要があります。
  • 期間限定:令和7年度限りの事業であり、令和7年9月30日までに導入完了したものが対象です。

対象となる医療機関


申請可能な条件
東京都内に開設する医療機関(健康保険法第63条第3項各号に定める病院又は診療所)であり、以下の条件を満たすもの。

1. 国の補助金(社会保険診療報酬支払基金)の交付決定を受けていること
2. 令和7年9月30日までに事業(導入)が完了していること

対象外となるケース

東京都が開設している病院および診療所
薬局(本事業は医療機関向けであり、薬局は別制度となります)
導入完了日が令和7年10月1日以降となる事業

補助金額と計算方法

補助金額の上限と補助率は、医療機関の規模(病床数など)によって明確に区分されています。ご自身の施設がどの区分に該当するかを確認し、予算計画にお役立てください。

1. 大規模病院(病床数200床以上)

事業内容 補助率 補助上限額
(1) 初期導入
システム改修・指導費など
1/6 811,000円
(2) 新機能導入
リフィル処方箋対応など
1/6 226,000円
(3) 同時導入
(1)と(2)を同時に行う場合
1/6 1,003,000円

2. 病院(大規模病院以外)

事業内容 補助率 補助上限額
(1) 初期導入 1/6 543,000円
(2) 新機能導入 1/6 167,000円
(3) 同時導入 1/6 676,000円

3. 診療所

事業内容 補助率 補助上限額
(1) 初期導入 1/4 97,000円
(2) 新機能導入 1/4 61,000円
(3) 同時導入 1/4 135,000円

申請の流れ

申請はすべて電子申請システム「Jグランツ」を通じて行われます。GビズIDの取得には時間がかかるため、未取得の方は最優先で手続きを進めてください。

1
GビズIDプライムの取得
Jグランツの利用には「GビズIDプライム」アカウントが必須です。発行までに2〜3週間かかる場合があるため、早急に申請してください。
2
システム導入・支払いの完了
期限:令和7年9月30日まで
上記期限までに、システム改修等の事業を完了し、支払いまで済ませておく必要があります。
3
Jグランツで申請
期間:令和7年10月1日(水) ~ 12月26日(金)
国の補助金交付決定通知書などの必要書類を揃え、電子申請を行います。
4
交付額確定・支払い
令和8年2月末頃に交付額の確定通知が届き、3月下旬に指定口座へ補助金が振り込まれる予定です。

審査のポイント

本補助金は「要件を満たせば交付される」性質のものです。コンテスト形式ではありませんが、以下のポイントで不備があると不採択になる恐れがあります。

ℹ️
審査通過のための重要事項
  • 整合性:国の補助金申請内容と、都への申請内容(金額や事業内容)に矛盾がないこと。
  • 完了日:導入完了日が令和7年9月30日以前であることが書類上で証明できること。
  • 期限厳守:12月26日の17時など、システムの締切時間を1分でも過ぎると受け付けられません。

注意点・よくあるミス

申請にあたり、特に誤解しやすい点や見落としがちなポイントをまとめました。

⚠️
ここだけは注意してください
  • 導入期限の厳守:令和7年10月1日以降に導入が完了した案件は対象外です。「申請期間」は10月からですが、「導入」はその前(9月中)に終えている必要があります。
  • 薬局は対象外:本事業は医療機関向けです。薬局向けの補助金は別途ご確認ください。
  • 単年度事業:本事業は令和7年度限りの実施予定です。次年度の実施は未定のため、この機会を逃さないようにしましょう。

よくある質問(FAQ)

Q
国の補助金を申請していませんが、都の補助金だけ申請できますか?

いいえ、申請できません。本事業は国の補助金への上乗せ補助という位置づけのため、国の補助金の交付決定を受けていることが必須条件となります。

Q
補助金はいつ振り込まれますか?

令和8年3月下旬の支払いを予定しています。令和8年2月末頃に交付額の確定通知が届くスケジュールとなっています。

Q
郵送での申請は可能ですか?

いいえ、原則としてJグランツによる電子申請のみとなります。インターネット環境とGビズIDの準備をお願いします。

申請すべきかの判断基準

手間をかけて申請する価値があるかどうか、以下のチェックリストで判断してください。

東京都内の病院または診療所である
国の補助金を申請済み、または申請予定である
令和7年9月30日までにシステム導入を完了できる見込みがある

上記の3つすべてに当てはまる場合は、申請を強くおすすめします。特に大規模病院の場合、最大100万円以上の補助となるため、経営上のインパクトは決して小さくありません。

今日からやるべきこと

申請受付は10月からですが、準備は今すぐ始める必要があります。以下の手順で進めましょう。

  1. GビズIDプライムの確認: IDを持っていない、またはパスワードを忘れた場合はすぐに手続きを。
  2. ベンダーへの相談: 「東京都の補助金を使いたいので、9月末までに導入完了させたい」とシステム業者に伝え、見積もりとスケジュールを確保してください。
  3. 国の補助金申請: まだの方は、社会保険診療報酬支払基金への申請を急ぎましょう。

公式情報・問い合わせ先

申請前に必ず最新の公募要領をご確認ください。不明点は事務局へ直接問い合わせるのが確実です。

📌
公式情報・お問い合わせ
公式サイト 東京都 公式ページを見る →
Jグランツ(申請サイト)を見る →
問い合わせ先 東京都医療機関・薬局における電子処方箋の活用・普及の促進事業事務局
電話:03-6837-0009
受付時間:平日 9:00〜17:00

※最新情報は必ず公式サイトでご確認ください。

免責事項:本記事は執筆時点の情報に基づいています。補助金の内容は変更される可能性があるため、申請前に必ず公式の公募要領をご確認ください。

最終更新:2025年1月15日

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補助金額 最大100万円 最大500万円最大60万円3万円3万円
補助率 施設規模により補助率が異なります。 ・大規模病院(病床数200床以上)および病院:補助対象経費の6分の1 ・診療所:補助対象経費の4分の1 診療所3/4、病院1/2、薬局3/4(大型チェーン1/2)購入費の3/4(上限3万円)購入費の3/4(上限3万円)
申請締切 2025年12月26日 2025年12月26日まで令和8年1月15日令和7年12月26日令和7年12月26日
難易度
採択率 30.0% 30.0%
オンライン 非対応 非対応対応非対応非対応
jGrants 非対応 非対応非対応非対応非対応
準備目安 約14日 約14日約14日約14日約14日
詳細 詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →

よくある質問

FAQ
Q この補助金の対象者は誰ですか?
都内に開設する医療機関(健康保険法第63条第3項各号に定める病院又は診療所)。ただし、都が開設している病院及び診療所を除く。
Q 申請に必要な書類は何ですか?
Jグランツでの電子申請となります。申請にはGビズIDプライムアカウントが必要です。また、申請の前提条件として、社会保険診療報酬支払基金からの補助金交付決定通知書が必要となります。その他、Jグランツ上で指定される申請様式や経費の内訳がわかる書類(見積書等)の提出が求められる可能性があります。詳細は公募開始後に発表される要綱をご確認ください。
Q どのような経費が対象になりますか?
補助対象経費は以下の通りです。
1. 電子処方箋管理サービスの初期導入費用:レセプトコンピューター及び電子カルテシステム等の既存システムの改修費、導入に付随する職員への実施指導等の費用。
2. 新機能の導入費用:「リフィル処方箋」「口頭同意による重複投薬等チェック結果の閲覧」「マイナンバーカード署名」「処方箋ID検索」に関する機能の導入費用。
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

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情報ソース
東京都
2025年11月30日 確認済み

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