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【令和7年度】医療機関・薬局向けシステム改修補助金(医療費助成オンライン資格確認)
受付終了 DX・デジタル化
申請受付は2026年1月15日(木)で終了しました。次回公募は未発表です。
まず確認すること
補助金の基礎データ 公募期間・実施機関・申請方法・公募要領 — 対象と金額は上の「まず確認すること」を参照
医療機関(病院、診療所)、薬局
- 対象地域
- 全国
- 対象者
- 医療機関(病院、診療所)、薬局
- 補助上限
- 最大60万円
- 補助率・給付条件 補助率とは
- 診療所3/4、病院1/2、薬局3/4(大型チェーン1/2)
- 公募期間
- 2025年6月6日〜2026年1月15日
- 実施機関
- 社会保険診療報酬支払基金
- 申請方法
- オンライン申請
- 必要書類
- 領収書、領収書内訳書、システム改修に係るチェックシー…
- 最大60万円まで補助される制度です
- 社会保険診療報酬支払基金が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン申請に対応
詳細解説
「マイナンバーカードで医療費助成の受給者証を確認できるようにしたい」「システム改修の費用負担を抑えたい」とお考えの医療機関・薬局の皆様へ。
厚生労働省による「医療費助成のオンライン資格確認に係る医療機関・薬局向けシステム改修補助金」は、公費負担医療や地方単独医療費助成の受給者証情報をオンラインで確認するためのレセプトコンピュータ改修等を支援する制度です。本記事では、補助金の詳細や申請手続きについて解説します。
この記事でわかること
- ―診療所、病院、薬局ごとの補助上限額と補助率
- ―対象となるシステム改修の具体的な内容(マイナ診察券対応など)
- ―令和7年6月6日から開始される申請受付のスケジュール
- ―申請に必要な「領収書」「内訳書」「チェックシート」の準備
- ―医療機関等向け総合ポータルサイトでの手続き方法
制度の概要
本補助金は、医療機関や薬局がマイナンバーカードを用いて医療費助成(公費負担医療、地方単独医療費助成)の受給者証情報をオンラインで確認できるようにするためのシステム改修費用を支援するものです。これにより、受給者証の提示が不要になるなど、患者・医療機関双方の利便性向上が期待されます。
表が画面に収まらない場合は、横にスクロールして確認できます。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 実施機関 | 社会保険診療報酬支払基金(厚生労働省) |
| 補助上限額 | 施設により異なる(最大60万円) |
| 補助率 | 3/4 または 1/2 |
| 申請期間 | 2025年6月6日〜2026年1月15日 |
| 申請方法 | オンライン申請 |
補助金額と補助率
医療機関の種類や改修内容によって補助上限額と補助率が異なります。
診療所
- 補助上限額:5.4万円(事業費7.3万円上限)
- 補助率:3/4
病院
- 再来受付機等の改修を含む場合:上限60.0万円(事業費120万円上限、補助率1/2)
- 再来受付機等の改修を含まない場合:上限28.3万円(事業費56.6万円上限、補助率1/2)
薬局
- 大型チェーン薬局以外:上限5.4万円(事業費7.3万円上限、補助率3/4)
- 大型チェーン薬局:上限3.6万円(事業費7.3万円上限、補助率1/2)
対象となる改修内容
以下のいずれかの改修を行う場合に補助対象となります。
- 1. 医療費助成のオンライン資格確認
医療費助成の受給者証情報をオンラインで取得するためのレセコン改修。
- 2. マイナ診察券対応との一体改修
上記に加え、マイナンバーカードを診察券として利用するための改修(マイナ診察券)も行う場合。
- 3. マイナ診察券のみの改修
マイナ診察券の機能を利用するためのレセコン改修のみを行う場合も対象です(診療所・病院のみ)。
申請の流れ
申請は「医療機関等向け総合ポータルサイト」から行います。
1
システム改修の実施
ベンダーに依頼し、レセコン等の改修を行います。
2
書類の準備
領収書、領収書内訳書、システム改修に係るチェックシート(ベンダー記入)を用意します。
3
申請
医療機関等向け総合ポータルサイトから申請します。
申請に必要な書類
以下の3点の書類が必要です。
- 領収書
- 領収書内訳書
- システム改修に係るチェックシート(ベンダーに記入を依頼してください)
まとめ
医療費助成のオンライン資格確認導入は、事務負担の軽減や患者サービスの向上につながります。補助金を活用して、システム改修をご検討ください。申請期限は2026年1月15日までですが、予算に限りがあるため、早めの申請をお勧めします。
申請をご検討の方へ
申請は「医療機関等向け総合ポータルサイト」から行えます。詳細は以下をご確認ください。
申請期限:2026年1月15日
情報ソース:厚生労働省、社会保険診療報酬支払基金(2025年6月確認)
※本記事の情報は作成時点のものです。最新情報は必ず公式サイトでご確認ください。

対象者・対象事業
対象地域(全国)
- 目的
- DX・デジタル化
- 対象地域
- 全国
- 対象者
- 医療機関(病院、診療所)、薬局
- 補助上限
- 最大60万円
- 申請の手間
- 初級(5段階中2)
詳細条件・対象自治体は公募要領をご確認ください。
補助金の概要
要点
対象・申請情報まとめ
詳細条件は公募要領で確認してください。
- 対象地域
- 全国
- 対象者
- 医療機関(病院、診療所)、薬局
- 補助上限
- 最大60万円
- 公募期間
- 2025年6月6日〜2026年1月15日
- 実施機関
- 社会保険診療報酬支払基金
- 主要スケジュール
- 申請期間2025年6月6日〜2026年1月15日申請受付締切2026年1月15日申請手順と注意点 ›
- 申請方法
- オンライン申請
- 必要書類
- 領収書、領収書内訳書、システム改修に… 詳細を見る ›
- 最大60万円まで補助される制度です
- 社会保険診療報酬支払基金が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン申請に対応
POINT!
この補助金のポイント
- 最大60万円まで補助される制度です
- 社会保険診療報酬支払基金が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン申請に対応
| 補助対象経費 | in 詳細を見る › |
|---|---|
| 公募期間 | 2025年6月6日〜2026年1月15日 |
| 実施機関 | 社会保険診療報酬支払基金 |
| 主要スケジュール |
|
| 申請方法 | オンライン申請 |
| 必要書類 | 領収書、領収書内訳書、システム改修に係るチェックシート 詳細を見る › |
| 公募要領 |
後継制度・次回公募
現時点で後継制度は確認できていません。
SUMMARY
この補助金のまとめ
- 最大60万円まで補助される制度です
- 社会保険診療報酬支払基金が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン申請に対応
編集・監修: 中澤圭志(中小企業診断士)
一次情報を確認する編集体制(編集方針・検証方法 | 掲載情報について連絡する)
本記事は一般的な情報提供を目的としています。補助額・対象要件・募集状況は変更される場合があるため、申請前に必ず各実施機関の公募要領・公式情報をご確認ください。

