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【全国】食品製造業向け最大9,000万円!業種横断型プロジェクト実証支援事業の申請ガイド(2025年)

3秒でわかる要点
農林水産省の「令和7年度 業種横断型プロジェクト実証支援事業」の申請ガイド。深刻な人手不足に悩む食品製造業向けに、AI・ロボットを活用した省力化技術開発を最大9,000万円(補助率1/2)で支援。コンソーシアム形成の要件や採択のポイント、2026年1月16日の締切に向けた申請手順を専門家が詳しく解説します。
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補助金詳細

確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大9,000万円
最大支給額
2026年1月16日
申請期限
普通
申請難易度

対象事業者(法人・個人)

主催機関
農林水産省
対象地域
全国
対象事業者
食品製造事業者、機械メーカー、システムインテグレーター、研究機関等で構成されるコンソーシアム等

主な申請要件・条件

● 対象経費
  • 機械設備導入・改良費、専門家謝金、旅費、委託費、人件費(直接従事分)、需用費、貸借料等
● 必要書類
課題提案書、経費内訳書、決算書(直近3年分)、コンソーシアム規約書、定款、組織規定等
補助率
採択率30.0%

補助金・助成金の概要

Overview

深刻な人手不足と生産性の低迷に直面する食品製造業界を救うため、農林水産省は令和7年度予算において大規模な支援策を打ち出しました。本事業は、食品事業者と機械メーカーがタッグを組み、AIやロボットを活用した革新的な省力化技術の開発・実証を最大9,000万円の補助金で強力にバックアップするものです。単なる設備導入にとどまらず、業界全体の課題を解決する次世代の技術開発を目指す全ての事業者にとって、またとない機会となります。

この記事でわかること

  • 業種横断型プロジェクト実証支援事業の全体像と補助金額
  • 申請対象となる事業者やコンソーシアムの要件
  • 採択率を高めるための戦略的な申請書の書き方
  • 2026年1月16日の締切に向けた具体的な申請ステップ

1. 令和7年度 業種横断型プロジェクト実証支援事業の背景と目的

日本の食品製造業は現在、極めて深刻な危機に瀕しています。有効求人倍率は全産業平均を大きく上回る約3倍に達しており、現場の労働力不足は限界を迎えています。また、食品製造業の労働生産性は全産業平均と比較して著しく低く、人手頼りの工程が数多く残されているのが現状です。

このような状況を打破するために策定されたのが『業種横断型プロジェクト実証支援事業』です。この事業の最大の特徴は、個別の企業が単独で動くのではなく、食品事業者と機械メーカー、ITベンダー、さらには大学や研究機関が連携する『コンソーシアム』による取組を重視している点にあります。業界の垣根を越えて(業種横断的)、特定の工程における自動化・省力化のモデルケースを創出することが期待されています。

制度のポイント

本事業は、単なる既存機械の購入支援ではありません。未だ解決されていない製造工程の課題に対し、新たな技術やAI、ロボット等を組み合わせて『実証開発』を行い、その成果を他の事業者にも広めていく(横展開)ことを目的としています。そのため、申請時には『公益性』と『汎用性』が重要な審査基準となります。

2. 支援内容と補助金額の詳細

本事業は主に2つの支援区分で構成されています。それぞれの目的に合わせて最適な枠組みを選択してください。

(1)技術開発プロジェクト支援(実証開発)

食品事業者と機械メーカー等が共同で、省力化技術の実証開発を行うプロジェクトを支援します。新規性の高い技術開発や、既存技術の画期的な組み合わせなどが対象となります。

補助上限額

9,000万円

補助率

1/2以内

(2)機械設備導入・改良支援(省力化モデル導入)

AIやロボット等の先端技術を活用した設備の導入、あるいは現場に合わせた改良を支援します。こちらはより実装に近い取組が対象となります。

補助上限額

4,000万円

補助率

1/2以内

3. 対象となる事業者とコンソーシアムの要件

本事業に申請できるのは、以下のいずれかの条件を満たし、かつ適切な経理管理体制を有する団体です。

  • 食品の加工・製造を行っている法人格を有する事業者(食品製造業者)
  • 食品事業者とともに事業を実施する機械メーカーやシステムインテグレーター(SIer)
  • 食品事業者を含む複数の団体で構成される事業化共同体(コンソーシアム)

重要:コンソーシアム結成の注意点

  • 全ての構成団体の同意を得た『規約書』または『協定書』をあらかじめ作成していること。
  • 補助金交付に係る全ての手続きを担う『代表団体』を明確に定めること。
  • 単なる一社のみの利益追求ではなく、業界全体への波及効果が期待できる体制であること。

4. 補助対象となる経費の範囲

プロジェクトの実施に直接必要となる経費が補助の対象となります。経費は他の事業と明確に区分し、証拠書類によって金額が確認できる必要があります。

経費項目具体的な内容
機械設備導入・改良費AI・ロボットを活用した製造・包装・検品設備の購入やカスタマイズ費用。
謝金プロジェクトに助言・監修を行う外部専門家、大学教授等への指導謝金。
旅費実証拠点への移動や、技術調査に要する公共交通機関の旅費等。
委託費自社で実施困難な特定の開発や調査を外部の専門企業に委託する費用。
人件費本事業に直接従事する者の直接作業時間に対する賃金(厳密な時間管理が必須)。

対象外となる経費の例

建物・施設の建設費、不動産取得費、交付決定前に発生した経費、消費税(仕入税額控除対象分)、タクシー代(原則)、飲食費などは補助の対象外となります。リース・レンタル料も本事業では対象外とされているため注意してください。

5. 想定される開発・実証分野と具体例

本補助金は、食品製造の『工程』に焦点を当てた開発を推奨しています。以下のような分野での取組が期待されています。

弁当・惣菜製造工程の自動化

多品種少量生産が求められる弁当・惣菜の現場では、手作業による『盛付』がボトルネックとなっています。AI画像認識を用いた柔軟な盛付ロボットや、異物混入・盛付ミスを自動判定する検品システムの開発が有望です。

パン・菓子製造の包装・搬送ライン

形が不揃いで柔らかい製品のハンドリングは困難を極めます。協働ロボットによるパレタイジング(積み付け)や、高速かつ製品を傷つけない自動包装システムの構築は、大幅な労働力削減に直結します。

野菜加工・一次処理の一貫自動化

洗浄、皮むき、カット、芯取りといった前処理工程を、一貫したラインとして自動化する取組です。特に、製品の個体差(大きさや形状)をセンサーで瞬時に判断し、最適なカットを行う技術は高く評価される傾向にあります。

6. 採択を勝ち取るための『5つの戦略ポイント』

補助金額が大きい分、審査も厳正に行われます。採択される申請書に共通するポイントを整理しました。

成功のためのチェックリスト

  • 定量的な数値目標:『人手が減る』だけでなく『労働生産性を〇%向上させる』『作業員を〇名から〇名に削減する』など具体的な数値を提示する。
  • 業界全体への波及効果:自社だけでなく、同業他社や他の食品分野でも活用可能な『汎用性』をアピールする。
  • 実現可能なスケジュール:実証開発から商用化までの道のりが具体的で、補助事業期間内の計画が緻密であること。
  • HACCP対応の考慮:食品安全の観点から、洗浄のしやすさや衛生管理機能が設計段階から組み込まれているか。
  • 保守・サポート体制:導入後のメンテナンスや、トラブル時の対応体制(SIerとの連携)が明確であること。

7. 申請から事業完了までのステップ

補助金申請には計画的な準備が必要です。以下のステップに沿って進めてください。

1
パートナー選定とコンソーシアム形成
食品事業者、機械メーカー、専門家等と連携体制を構築し、役割分担を明確にします。
2
課題提案書の作成・提出
2025年12月16日から2026年1月16日までに電子メールにて必要書類を提出します。
3
審査・交付決定
選定審査委員会による審査を経て、採択者が通知されます。その後、正式な交付申請を行います。
4
事業実施(実証開発・設備導入)
交付決定後に事業を開始。経費の支払いは全て記録に残し、証拠書類を保管してください。
5
実績報告・補助金入金
事業完了後、実績報告書を提出。検査を経て額が確定し、補助金が精算払い(後払い)されます。

8. よくある質問(FAQ)

Q

個別の食品事業者一社のみで申請することは可能ですか?

本事業の趣旨は『業種横断型』のプロジェクトであり、食品事業者と機械メーカー等の連携が基本となります。単なる自社専用の自動化設備の導入は補助対象外となる可能性が高いため、コンソーシアム形式での申請を強く推奨します。

Q

補助金はいつ頃もらえますか?

補助金は原則として『精算払い(後払い)』です。事業が完了し、実績報告書の検査が終わった後に入金されます。そのため、事業期間中の資金繰りについては自社で手当てする必要があります。

Q

過去に別の補助金を受けたことがあっても申請できますか?

申請自体は可能ですが、同一のテーマ・内容で重複して他の公的補助を受けることはできません。全く異なるプロジェクトや、別の工程の改善であれば問題ありません。

Q

人件費の算定方法はどのようになりますか?

本事業に直接従事した時間のみが対象となります。勤務実績表や作業日誌等により、他の業務と明確に区分されていることが必要です。算定にあたっては大臣官房経理課の通知に基づいた適正な計算が求められます。

Q

海外メーカーの機械は対象になりますか?

基本的には国内に所在し、補助金の適正な執行に責任を負える団体が対象です。機械自体が海外製であっても、国内の代理店やSIerがコンソーシアムに加わり、国内での保守体制が担保されていれば検討の余地はありますが、公募要領の最新情報を必ず確認してください。

9. まとめ:食品製造の未来を切り拓くために

『業種横断型プロジェクト実証支援事業』は、単なる資金援助の枠を超え、日本の食品産業が抱える構造的な問題を根本から解決するための呼び水となる制度です。最大9,000万円という手厚い支援を活用し、AIやロボットを駆使した革新的な現場を構築することは、企業の持続可能性を高めるだけでなく、従業員の働く環境改善にも大きく貢献します。締切は2026年1月16日です。パートナー企業の選定や計画策定には時間を要するため、今すぐ準備を開始することをお勧めします。

詳細情報と公募要領の確認はこちら

農林水産省 大臣官房新事業・食品産業部 食品製造課
原材料調達・品質管理改善室 国産切替企画調整班
電話:03-6744-2089

免責事項: 本記事の情報は2025年12月19日時点のものです。本事業は令和7年度補正予算案等に基づいているため、成立状況により内容が変更される可能性があります。申請にあたっては必ず農林水産省の公式サイトより最新の公募要領をご確認ください。

申請前チェックリスト

0 / 5 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
食品製造事業者、機械メーカー、システムインテグレーター、研究機関等で構成されるコンソーシアム等
必須 対象経費に該当する事業である
機械設備導入・改良費、専門家謝金、旅費、委託費、人件費(直接従事分)、需用費、貸借料等
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2026年1月16日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
課題提案書、経費内訳書、決算書(直近3年分)、コンソーシアム規約書、定款、組織規定等
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です

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採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
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補助金額最大9,000万円最大25万円最大100万円(ひめボス認証制度)など、制度により異なる上限100万円最大333.3万円経済産業省推進(受講費有料)
補助率補助対象経費の1/2以内(千円未満切捨て)国の助成額の1/10(えひめ業務改善応援金)、報酬費用の1/2(社労士等への報酬費用補助)、奨学金返還額の4/5(奨学金返還支援制度)など、制度によって補助率や算出方法は異なります。補助対象経費の1/2以内。ただし、県内における大学等・公設試との共同研究費は10/10となります。補助対象経費の2/3以内。消費税及び地方消費税は対象外。補助額に1,000円未満の端数がある場合は切り捨て。
申請締切2026年1月16日令和8年1月9日(金)まで ※事前相談の締切は令和7年12月23日(火)令和7年3月7日まで(えひめ業務改善応援金)など、各制度により異なる2025年10月1日〜2025年10月15日令和7年9月16日(火)令和7年8月上旬(事業者により異なる)
難易度
採択率 AI推定 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 84.0% ※参考値
準備目安約14日約14日約14日約14日約14日約14日
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よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
食品製造事業者、機械メーカー、システムインテグレーター、研究機関等で構成されるコンソーシアム等
Q 申請に必要な書類は何ですか?
課題提案書、経費内訳書、決算書(直近3年分)、コンソーシアム規約書、定款、組織規定等
Q どのような経費が対象になりますか?
機械設備導入・改良費、専門家謝金、旅費、委託費、人件費(直接従事分)、需用費、貸借料等
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

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補助金図鑑 #154166
2026年版
情報ソース
農林水産省
2025年12月22日 確認済み

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