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【群馬・愛知・宮城】医療機関・薬局向け最大100万円!電子処方箋導入補助金の申請ガイド(2025年)

3秒でわかる要点
群馬県、愛知県、宮城県などの自治体が実施する電子処方箋導入補助金(最大100万円)について、申請要件や手続き、補助金額を徹底解説。国の補助金との併用ルールや、令和7年9月末までの導入期限など、医療機関や薬局が知っておくべき重要ポイントを網羅。jGrantsを用いた申請フローや必要書類の準備方法も紹介します。
約14分で読了 38回閲覧 2025年12月27日最新情報

補助金詳細

01
確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大100万円
最大支給額
2026年1月31日
(残り16日)
普通
申請難易度

対象者

主催機関
各自治体(健康福祉部・薬務課等)
対象地域
宮城県 他
対象事業者
県内に開設する保険医療機関(病院・診療所)および保険薬局

申請要件

● 対象経費
  • 電子処方箋管理サービスの初期導入費用、新機能(リフィル、重複投薬チェック等)の導入費用
● 必要書類
システム導入領収書、支払基金交付決定通知書、通帳写し、取り組み写真等
補助率
採択率 90.0%
Section 02

補助金概要

Overview
この補助金に関する詳細な説明と申請に必要な情報を掲載しています。最新情報は公式サイトで必ずご確認ください。

電子処方箋の普及を目的として、各自治体(群馬県、愛知県、宮城県等)では医療機関や薬局を対象に導入費用の補助を実施しています。本補助金は国の補助金に上乗せされる形で支給され、大規模病院では最大100万円を超える支援を受けることが可能です。対象となる事業内容や申請期限、手続きの注意点を詳しく解説します。

この記事でわかること

  • 自治体ごとの補助上限額と補助率の違い
  • 初期導入だけでなく新機能追加も対象となる範囲
  • 国の補助金(支払基金)との連動ルールと申請順序
  • jGrantsやオンラインシステムを用いた具体的な申請フロー

電子処方箋活用・普及促進事業補助金の概要

厚生労働省が進める医療DXの一環として、電子処方箋の導入が加速しています。電子処方箋は、従来の紙の処方箋をデジタル化することで、リアルタイムでの重複投薬チェックや併用禁忌の確認を可能にし、医療の安全性を向上させる仕組みです。本補助金は、このシステム導入にかかるシステム改修費や周辺機器の購入費を支援するものです。

1. 補助対象者と施設区分

補助の対象となるのは、各県内に開設されている保険医療機関(病院・診療所)および保険薬局です。自治体によって細かな対象範囲が異なりますが、概ね以下の区分に基づき補助上限が設定されています。

  • 大規模病院(病床数200床以上)
  • 病院(病床数200床未満)
  • 診療所(クリニック)
  • 保険薬局

重要な申請条件:令和7年9月30日までの導入完了

  • 原則として、令和7年9月30日までに電子処方箋管理サービスの導入を完了している必要があります。
  • 自治体の補助金を申請する前に、社会保険診療報酬支払基金(国)からの補助金交付決定を既に受けていることが必須条件となります。

補助対象となる事業内容と経費

補助の対象は、単なる初期導入にとどまりません。最新の医療ニーズに対応するための新機能導入も含まれます。

補助対象事業の3つのパターン

事業区分 具体的な内容
(1)初期導入費用 電子処方箋管理サービスの運用を新たに開始するためのシステム構築費用。
(2)新機能導入費用 リフィル処方箋、口頭同意による重複投薬等チェック、マイナンバーカード署名対応などの追加機能。
(3)同時導入費用 初期導入と新機能の追加を同一のタイミングで実施する場合の費用。

補助対象外となるケース

院内処方機能の導入にかかる費用は、原則として本補助金の対象外となります。また、昨年度すでに県の上乗せ補助金を受給した施設は、同一の事業区分での再申請はできません(異なる区分であれば可能な場合があります)。

自治体別の補助金額と上限設定

自治体ごとに補助率および上限額が細かく定められています。以下に主要な自治体の例をまとめます。

愛知県・宮城県の事例(施設別上限額)

施設区分 補助率 初期導入上限 新機能追加上限 同時導入上限
大規模病院 1/6 81.1万円 22.6万円 100.3万円
病院 1/6 54.3万円 16.7万円 67.6万円
診療所・薬局 1/4 9.7万円 6.1~6.4万円 13.5~13.8万円

群馬県の事例(薬局向け)

薬局:同時導入上限

13.8万円

失敗しないための申請フローとスケジュール

本補助金は、国の補助金(ICT基金)と密接に連動しています。申請の順番を間違えると受給できない可能性があるため、以下のステップを確実に踏んでください。

1
システム事業者への発注・導入
まずは電子処方箋管理サービスの導入を完了させ、運用を開始します。令和7年9月末までの完了が必須条件です。
2
社会保険診療報酬支払基金への申請
国のポータルサイトからICT基金(電子処方箋)の補助金申請を行います。この交付決定通知書が県への申請に必要となります。
3
GビズIDの取得(jGrants利用時)
愛知県などのjGrantsを利用する自治体の場合、gBizIDプライムアカウントの取得が必要です。取得には2~3週間かかるため、早めに着手してください。
4
自治体への本申請
支払基金の交付決定通知を受け取った後、各県指定のシステム(jGrants、LoGoフォーム等)から申請を行います。
5
補助金の受領と実績報告
審査完了後、補助金が振り込まれます。宮城県のように「仕入控除税額報告」が別途必要な場合もあるため、完了後の手続きも確認が必要です。

申請時に必要な書類一覧

オンライン申請時に、以下の書類のPDFまたは画像データのアップロードが求められます。不足や不備があると審査が遅れる原因となります。

準備すべき提出書類

  • システム導入に関する領収書の写し(内訳がわかるもの)
  • 社会保険診療報酬支払基金から発行された交付決定通知書の写し
  • 振込先口座の確認できる通帳の写し(表紙および見開きページ)
  • (自治体により)広報ポスター掲示などの取り組みがわかる写真
  • 法人等の場合、寄付金等その他収入がある場合はその額がわかる書類

よくある質問(FAQ)

Q

国の補助金を申請中ですが、県の補助金も同時に申し込めますか?

いいえ、できません。県(自治体)の補助金を申請するには、まず社会保険診療報酬支払基金(国)からの交付決定を受けている必要があります。交付決定通知書が必須の添付書類となります。

Q

すでにシステムを導入して運用を開始していますが、対象になりますか?

はい、対象となります。令和7年9月30日までに導入が完了しており、かつ適切な領収書等の証憑書類が揃っていれば、さかのぼって申請することが可能です。

Q

jGrantsでの申請にはgBizIDエントリーでも大丈夫ですか?

いいえ、gBizIDエントリーではjGrantsを利用できません。gBizIDプライムまたはメンバーのアカウントが必要です。プライムアカウントの取得には郵送による審査等で時間がかかるため、早めに申請してください。

Q

郵送や窓口での申請は受け付けていますか?

原則として、オンライン申請(jGrantsやLoGoフォーム)のみの受付となっています。紙媒体での申請は受け付けていない自治体が多いため、ネット環境の整備とデジタルの準備が必要です。

Q

予算がなくなると期限前でも終了しますか?

はい、多くの自治体で『予算に達し次第、受付終了』という規定があります。条件を満たした後は、できるだけ早急に申請することをお勧めします。

専門家による申請ノウハウと採択のコツ

補助金申請をスムーズに進めるためには、事務作業の効率化と正確な書類準備が欠かせません。以下のポイントを意識してください。

1. 領収書の『内訳』を明確にする

システム事業者から発行される領収書には、必ず『電子処方箋管理サービス導入費用』など、補助対象であることがわかる明細を記載してもらってください。一括で『システム改修一式』とされている場合、補助対象外の費用(電子カルテの他機能改修など)が含まれていると判断され、減額される可能性があります。

2. 自治体独自の『協力義務』を確認する

群馬県や宮城県のように、補助金交付の条件として『ポスターの掲示』や『デジタルサイネージでの広報協力』を求めている場合があります。これらの活動実態を示す写真の提出が求められることもあるため、導入後の運用風景も記録しておきましょう。

電子処方箋の導入は、今後の医療DXにおいて避けては通れないステップです。国の補助金と自治体の上乗せ補助金を併用することで、実質的な自己負担を大幅に抑えることが可能です。令和7年9月の期限は、システム事業者の混雑も予想されるため、余裕を持ったスケジュールでの発注を推奨します。

最新情報のご確認をお忘れなく

各自治体のホームページでは随時Q&Aが更新されています。申請前には必ず各県の薬務課等の公式サイトをご確認ください。

免責事項: 本記事の情報は作成時点(2025年)のものです。各自治体の予算状況や制度変更により、補助金額や申請条件が変更される場合があります。必ず申請前に各自治体の公式サイトおよび交付要綱をご確認ください。

03

申請前チェックリスト

0 / 6 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
県内に開設する保険医療機関(病院・診療所)および保険薬局
必須 対象地域に該当する
対象: 宮城県、愛知県、群馬県
必須 対象経費に該当する事業である
電子処方箋管理サービスの初期導入費用、新機能(リフィル、重複投薬チェック等)の導入費用
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2026年1月31日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
システム導入領収書、支払基金交付決定通知書、通帳写し、取り組み写真等
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です
05

類似補助金との比較

採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
比較項目
この補助金 各自治体(健康福祉部・薬務課等)
【大阪市】障がい児通所支援事業者向け最大560万円... 大阪市
【摂津市】障害児福祉サービス事業所向け最大10万円... 摂津市 こども政策課
【神奈川・福岡・山形他】医療機関向け最大4万円/病... 各都道府県(健康医療局・保健医療部等)
【全国】医療機関向け最大1,114万円!医療施設経... 厚生労働省および各都道府県(保健医療局等)
補助金額 最大100万円 最大560万円最大10万円最大4万円(1病床あたり)または18万円/施設最大1,114万円(加算時)
補助率
申請締切 2026年1月31日 令和8年2月20日まで令和8年1月20日まで(最終期限3月31日)自治体により異なる(令和7年12月から令和8年2月等)自治体により異なる(多くは令和7年度末まで)
難易度
採択率 AI推定 90.0% ※参考値 80.0% ※参考値 90.0% ※参考値 90.0% ※参考値 60.0% ※参考値
準備目安 約14日 約14日約14日約14日約14日
詳細 詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →
06

よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
県内に開設する保険医療機関(病院・診療所)および保険薬局
Q 申請に必要な書類は何ですか?
システム導入領収書、支払基金交付決定通知書、通帳写し、取り組み写真等
Q どのような経費が対象になりますか?
電子処方箋管理サービスの初期導入費用、新機能(リフィル、重複投薬チェック等)の導入費用
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

CONTACT
補助金図鑑 #154354
2026年版
情報ソース
各自治体(健康福祉部・薬務課等)
2025年12月27日 確認済み
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