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【全国】自治体・民間事業者向け最大50億円!バイオマス・地域脱炭素補助金申請ガイド(2025年)

3秒でわかる要点
令和6年度補正および令和7年度予算案に基づく、バイオマス・地域脱炭素関連の補助金情報を網羅。最大50億円の交付金から設備導入、研究開発支援まで、自治体や民間事業者が活用できる主要な支援策の要件、補助率、採択率を高める申請ノウハウを詳しく解説します。
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補助金詳細

01
確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大50.0億円
最大支給額
2026年3月31日
(残り74日)
普通
申請難易度

対象事業者(法人・個人)

主催機関
環境省、農林水産省、総務省、文部科学省、経済産業省等
対象地域
全国
対象事業者
地方自治体、民間事業者、大学、研究機関、非営利団体等

主な申請要件・条件

● 対象経費
  • 施設整備費、設備導入費、詳細設計費、実証試験費、計画策定費、人件費、旅費、委託費等
● 必要書類
事業計画書、収支予算書、財務諸表、定款、納税証明書、地域金融機関の融資確約書(対象事業のみ)等
補助率
採択率 40.0%
Section 02

補助金・助成金の概要

Overview
この補助金に関する詳細な説明と申請に必要な情報を掲載しています。最新情報は公式サイトで必ずご確認ください。

わが国が掲げる2050年カーボンニュートラルおよび2030年度の温室効果ガス削減目標の実現に向け、令和6年度補正予算および令和7年度予算案において、バイオマス利活用と地域脱炭素化を強力に後押しする多岐にわたる支援策が打ち出されました。本記事では、最大50億円に達する大規模な交付金から、民間事業者の初期投資を支える補助金、さらには先端的な研究開発支援まで、自治体や企業が活用できる主要な支援施策の要件や補助率、申請のポイントを網羅的に解説します。

この記事でわかること

  • 令和6年度補正・令和7年度当初予算におけるバイオマス・脱炭素関連の主要施策
  • 自治体および民間事業者が受け取れる補助額・補助率の詳細
  • バイオマス資源(家畜排せつ物、木質、食品廃棄物等)別の活用支援策
  • 採択率を高めるための申請ノウハウと具体的なステップ

1. 令和6年度・7年度予算における主要な脱炭素・バイオマス支援施策

今回の予算案では、内閣府、総務省、文部科学省、農林水産省、経済産業省、国土交通省、環境省の7府省が連携し、地域における資源循環とエネルギー自給を加速させるための支援をパッケージ化しています。特に『地域脱炭素移行・再エネ推進交付金』や『ローカル10,000プロジェクト』など、地域の特色を活かした事業への支援が手厚くなっているのが特徴です。

【環境省】地域脱炭素推進交付金(最大50億円規模)

地域全体で再エネ・省エネ・蓄エネを推進し、脱炭素製品・技術の需要創出を行う自治体を支援します。特に『脱炭素先行地域』への選定や『重点対策加速化事業』を通じて、大規模な投資を後押しします。

特定地域脱炭素移行加速化交付金(上限額)

5,000,000,000円

【総務省】ローカル10,000プロジェクト(地域経済循環創造事業交付金)

産官学金労言の連携により、地域の資源と資金を活用した地域密着型事業の立ち上げを支援します。民間事業者が地域金融機関から融資を受けて取り組む事業に対し、初期投資費用を補助する仕組みです。

補助率(脱炭素・地域再エネ活用等)

最大 3/4

2. 事業目的別の支援メニュー詳細

支援策は、施設の整備だけでなく、計画策定や研究開発など、事業のフェーズに応じて選択することが可能です。以下に主要な事業を類型別に整理しました。

【施設整備・設備導入支援】

事業名 対象者 補助率・上限
建築物等のZEB化・省CO2化普及加速事業 民間事業者、自治体等 最大2/3、上限5億円
廃棄物処理施設を核とした地域循環共生圏構築促進事業 自治体、民間団体等 最大1/2等(事業内容による)
地域レジリエンス・脱炭素化を同時実現する公共施設への設備導入 自治体、民間事業者等 最大2/3、上限規定なし(詳細は公式サイトを確認)(詳細設計500万円)

採択に向けた重要ポイント

  • 補助金によって『自治体との連携』や『地域金融機関からの融資』が必須要件となる場合があります。
  • 脱炭素先行地域での事業実施は、多くの補助金において加点対象となります。
  • CO2削減効果(費用対効果)が厳しく審査されるため、定量的な根拠データが必要です。

3. バイオマス資源別の活用支援策ガイド

バイオマスの利活用は、その種類(家畜排せつ物、木質、食品廃棄物など)に応じて担当省庁や支援内容が異なります。自社の扱う資源に最適な施策を見極めることが重要です。

家畜排せつ物・食品廃棄物のエネルギー利用

主に農林水産省の『みどりの食料システム戦略推進交付金』や、環境省の『廃棄物処理施設を核とした地域循環共生圏構築促進事業』が対象となります。バイオガス発電や肥料化などの施設整備、および地域内でのエネルギー循環システムの構築が支援されます。

木質バイオマスの利用環境整備

林野庁の『木材需要の創出・輸出力強化対策』における『木質バイオマス利用環境整備事業』などが中心です。未利用材の収集運搬システムの構築や、木質バイオマスボイラー等の導入支援が行われます。また、経済産業省の『木質バイオマス燃料等の安定的・効率的な供給・利用システム構築支援事業』も注目です。

下水汚泥・資源作物の利活用

国土交通省の『下水道脱炭素化推進事業』や、農林水産省の『地域循環型エネルギーシステム構築』が活用できます。下水汚泥の燃料化・肥料化、あるいはエリアンサスやソルガムといった資源作物のエネルギー利用に向けた実証試験・施設整備が支援対象となります。

4. 研究開発・実証試験に向けた強力なバックアップ

既存の技術だけでなく、次世代の脱炭素技術を生み出すための研究開発支援も充実しています。大学や研究機関、スタートアップ企業にとって大きなチャンスとなります。

【文部科学省】共創の場形成支援プログラム

SDGsに基づく未来のありたい社会像を掲げ、産学官共創による研究開発をパッケージで推進します。地域共創分野では、地域課題の解決と経済発展を同時に目指すプロジェクトを長期間にわたり支援します。

本格型支援の概要

年間最大4億円程度、最長10年間にわたる継続的な支援が可能です。自立的な拠点形成を目指す産学官チームに最適です。

【文部科学省】研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)

大学等の優れた技術シーズを、企業等とのマッチングやハンズオン支援を通じて実用化・社会実装へと繋げます。ステージに応じたグラント型(上限1,500万円/年)や、本格的な実装支援(返済型、上限5億円)が用意されています。

5. 補助金申請の成功率を高めるノウハウ(自律補足)

官公庁の補助金は、単に書類を提出すれば良いわけではありません。審査員の視点を理解し、戦略的に申請書類を作成することが求められます。

1. 社会的インパクトと政策合致性の強調

『なぜ自社がこの事業を行う必要があるのか』だけでなく、『この事業が地域の脱炭素化や日本全体のGX(グリーントランスフォーメーション)にどう貢献するのか』を明確に記述してください。特に、みどりの食料システム戦略や地域脱炭素ロードマップなど、最新の政府方針を引用することが効果的です。

2. 事業の持続可能性と経済性の証明

補助金期間終了後も事業が自律的に継続できるかどうかが厳しく問われます。原料(バイオマス)の安定調達ルート、生成物の販売先、維持管理コストの算出根拠を具体的に示し、キャッシュフローに無理がないことを証明しましょう。

3. 専門家・コンサルタントの戦略的活用

多くの採択事業者は、補助金コンサルタントや行政書士、技術士などの外部専門家を活用しています。特に大規模な施設整備事業では、技術的な妥当性確認(FS調査)や、複雑な財務計画の策定において専門家の知見が不可欠です。専門家報酬の一部が補助対象となる事業も多いため、積極的に検討しましょう。

6. 申請から事業実施までの5ステップ

1
事前準備と情報収集
公募要領を熟読し、自社の事業が要件を満たしているか確認します。gBizIDプライムアカウントの取得など、電子申請の準備も並行して行います。
2
事業計画の策定と連携体制の構築
自治体、協力企業、金融機関等との合意形成を行い、具体的な事業スキームを固めます。バイオマスの調達やエネルギー利用の確約を得ることが重要です。
3
申請書類の作成と提出
事業計画書、経費予算書、財務諸表などの必要書類を作成します。電子申請システム経由での提出が多く、締め切り直前はサーバーが混雑するため余裕を持って提出しましょう。
4
審査・採択・交付決定
書面審査やヒアリング審査が行われます。無事に採択された後、事務局とのやり取りを経て『交付決定』が下りてから、初めて設備の発注や事業契約が可能になります。
5
事業実施と実績報告
計画に沿って事業を実施し、進捗状況の報告を行います。事業終了後には『実績報告書』を提出し、精査を経て確定した補助金額が支払われます(後払いが原則です)。

よくある質問(FAQ)

Q

予算成立前でも申請の準備は進めても良いでしょうか?

はい、むしろ早期の準備が推奨されます。令和7年度予算案の公募は多くの場合3月から4月にかけて始まります。公募期間は1ヶ月から2ヶ月程度と短いため、予算案の情報を元に今のうちから事業計画を練り、協力パートナーとの協議を進めておくことが採択への近道です。

Q

複数の省庁の補助金を組み合わせて使うことはできますか?

原則として、同一の設備・経費に対して複数の国費補助金を二重に受け取ることはできません。ただし、事業全体のフェーズを分けて(例:FS調査は環境省、施設整備は農水省)、あるいは対象範囲を明確に区分して申請することは可能な場合があります。詳細は各補助金の事務局へ確認が必要です。

Q

『ローカル10,000プロジェクト』の金融機関融資は必須ですか?

はい、本事業の大きな特徴として、地域金融機関からの融資が必須要件となっています。地域金融機関の目利きを通じて、事業の経済性や継続性が客観的に評価されていることが、国および自治体が支援する前提条件となります。

Q

中小企業は大企業に比べて不利になりますか?

むしろ、多くの補助金において中小企業には高い補助率(例:大企業1/3に対し中小企業1/2など)が設定されており、有利な条件で申請できる仕組みになっています。また、地域経済への波及効果の観点から、地元の中小企業が参画するプロジェクトは高く評価される傾向にあります。

Q

補助金の採択率はどのくらいでしょうか?

事業により大きく異なりますが、競争的な補助金では30パーセントから50パーセント程度となることが多いです。ただし、要件を正確に満たし、定量的な削減効果を示した完成度の高い計画書であれば、採択の可能性は大幅に高まります。

令和6年度補正および令和7年度予算案におけるバイオマス・脱炭素支援策は、わが国の産業競争力を高め、持続可能な地域社会を構築するための重要なエンジンです。最大50億円の交付金から、身近な設備導入まで、自社の事業規模やフェーズに合わせた最適な補助金を選択し、戦略的な準備を進めてください。脱炭素への投資は、単なるコストではなく、将来の企業価値を高める先行投資となります。

最新の補助金情報を逃さないために

各府省庁の公式サイトや事務局のホームページを定期的にチェックすることをお勧めします。早期の専門家相談が、プロジェクト成功の鍵を握ります。

免責事項: 本記事の情報は令和7年2月時点の予算案および公表資料に基づき作成しています。今後、国会での予算成立や法律の改正、政府方針の変更等により、事業内容や補助金額、要件等が変更・中止される場合があります。申請にあたっては必ず各省庁・事務局が発行する最新の公募要領をご確認ください。

03

申請前チェックリスト

0 / 5 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
地方自治体、民間事業者、大学、研究機関、非営利団体等
必須 対象経費に該当する事業である
施設整備費、設備導入費、詳細設計費、実証試験費、計画策定費、人件費、旅費、委託費等
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2026年3月31日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
事業計画書、収支予算書、財務諸表、定款、納税証明書、地域金融機関の融資確約書(対象事業のみ)等
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です
05

類似補助金との比較

採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
比較項目
この補助金 環境省、農林水産省、総務省、文部科学省、経済産業省等
【2025年】商用車電動化促進事業(トラック)を解... 環境省(執行団体:一般社団法人 環境パートナーシップ会議など)
【2025年度】品川区しながわゼロカーボンアクショ... 品川区
【四国中央市】事業用EV導入で経費1/3補助!令和... 四国中央市 経済部 産業支援課
【静岡県】事業者・自治体向け最大1.6億円!ZEB... 環境省(事務局:一般社団法人静岡県環境資源協会等)
補助金額 最大50.0億円 車両価格と基準価格の差額の最大3/4(車両)、導入費用の最大1/2(充電設備)など最大300万円補助対象経費の3分の1と、車両区分に応じて定める額のいずれか少ない方の額最大1億6,000万円(新築集合住宅等)
補助率 補助対象経費(国、県又は公的団体から助成等を受けているときは、当該補助対象経費から当該助成等の額を控除した額)の3分の1と、車両区分に応じて定める額のいずれか少ない方の額(1,000円未満切り捨て)。
申請締切 2026年3月31日 2025年10月26日(予定)※予算上限に達し次第、早期終了の可能性あり2026年3月31日(火)まで ※先着順、予算に達し次第終了令和7年5月15日から予算上限に達するまで令和7年4月30日まで(二次公募)
難易度
採択率 AI推定 40.0% ※参考値 60.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 45.0% ※参考値
準備目安 約14日 約14日約14日約14日約14日
詳細 詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →
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よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
地方自治体、民間事業者、大学、研究機関、非営利団体等
Q 申請に必要な書類は何ですか?
事業計画書、収支予算書、財務諸表、定款、納税証明書、地域金融機関の融資確約書(対象事業のみ)等
Q どのような経費が対象になりますか?
施設整備費、設備導入費、詳細設計費、実証試験費、計画策定費、人件費、旅費、委託費等
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

CONTACT
補助金図鑑 #155070
2026年版
情報ソース
環境省、農林水産省、総務省、文部科学省、経済産業省等
2025年12月29日 確認済み
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AIアシスタント

AI
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