【全国】脱炭素スタートアップ必見！研究開発費を定額支援する環境省事業の申請ガイド（2025年）

環境省が主導する令和7年度スタートアップ支援事業は、脱炭素社会の実現に向けた革新的な技術開発を支援する公募制度です。スタートアップ企業を対象に、エネルギー起源および非エネルギー起源のCO2排出削減に資する研究開発（POC・FS）を定額補助の形で強力にバックアップします。本記事では、公募の種類、採択のポイント、申請に必要な準備について詳しく解説します。

環境省スタートアップ支援事業の概要と目的

本事業は、先端技術を的確に社会実装・普及させて脱炭素社会を実現することを目的としています。特に、既存の技術では到達困難な高い削減目標を達成するため、スタートアップ企業の機動力とイノベーション能力を最大限に活用することを目指しています。国の政策を踏まえつつ、地域社会のニーズを解決するテーマ設定枠や、技術シーズに基づくボトムアップ型の取り組みを並行して推進しているのが特徴です。

1. 地域共創・セクター横断型カーボンニュートラル技術開発・実証事業

主にエネルギー起源CO2、すなわち化石燃料（石油、石炭、天然ガス等）の使用に伴って発生する二酸化炭素の排出抑制に資する事業を支援します。スタートアップ企業に対する事業促進支援事業として、特定の地域課題と結びついた技術開発や、複数のセクターにまたがる横断的なソリューションが期待されています。

2. 環境保全研究費補助金（イノベーション創出のための環境スタートアップ研究開発支援事業）

こちらは非エネルギー起源CO2排出量の削減に貢献する事業が対象となります。工業プロセス（セメント製造、化学工業等）や廃棄物の焼却、農林水産業など、エネルギー燃焼以外から生じる温室効果ガスの削減、さらには循環経済（サーキュラーエコノミー）や自然共生社会の実現に寄与する革新的な研究開発を支援します。

支援対象となる具体的な経費とフェーズ

本補助金は、SBIR（Small Business Innovation Research）制度の一環として位置づけられており、技術の成熟度（TRL）に応じた段階的な支援が行われます。

補助対象経費の主な項目

• 人件費：研究員や開発担当者の直接従事分。
• 設備費：事業に必要な機械装置の購入、試作開発費。
• 旅費：実証試験や打ち合わせに伴う移動経費。
• 外注費・委託費：専門的な分析や設計の外部委託。
• その他諸経費：原材料費、消耗品費、特許出願費用など。

採択率を高めるための3つの戦略

環境省のスタートアップ支援事業は、単なる技術的な革新性だけでなく、その技術がどれだけ具体的にCO2削減に寄与し、社会に普及するかという視点が厳しく評価されます。以下のポイントを意識して申請書を作成しましょう。

申請から事業完了までのステップ

申請にはデジタル庁が運営する電子申請システム「jGrants」の利用が必須となる場合が多いです。事前の準備が合否を分けることもあります。

よくある質問 (FAQ)