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【2025年度】医療費助成オンライン資格確認システム改修補助金|最大60万円・医療機関/薬局向け・締切1月15日

3秒でわかる要点
【2025年度】医療費助成オンライン資格確認システム改修補助金は医療機関・薬局向けに最大60万円を支援。予算内交付のため早期申請を推奨。申請方法・必要書類・締切1月15日を完全解説。
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補助金詳細

確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大60万円
最大支給額
2026年1月15日
申請期限
普通
申請難易度

対象事業者(法人・個人)

主催機関
厚生労働省(助成実施:社会保険診療報酬支払基金)
対象地域
全国
対象事業者
医療費助成のオンライン資格確認を導入するため、またはマイナンバーカードを診察券として利用するためにレセプトコンピュータ等のシステム改修を行う病院、診療所、薬局。

主な申請要件・条件

● 対象経費
  • ・医療費助成の受給者証情報をオンラインで取得するためのレセプトコンピュータ(レセコン)の改修費用
  • ・マイナンバーカードを診察券として利用するためのレセコン等の改修費用
  • ・【病院のみ】マイナ診察券に対応するための再来受付機の改修費用または購入時のオプション費用
● 必要書類
・領収書
・領収書内訳書
・システム改修に係るチェックシート(システムベンダーが記入)
補助率【病院】対象経費の1/2(上限28.3万円または60万円) 【診療所】対象経費の3/4(上限5.4万円) 【薬局(大型チェーン以外)】対象経費の3/4(上限5.4万円) 【薬局(大型チェーン)】対象経費の1/2(上限3.6万円)
採択率30.0%

補助金・助成金の概要

Overview

対象となる方

  • 医療費助成のオンライン資格確認導入のため、レセプトコンピュータ等のシステム改修を行う病院、診療所、薬局
  • マイナンバーカードを診察券として利用するためのシステム改修を検討している医療機関
  • 2024年度(令和6年度)以降にシステム改修を実施した、または予定している事業者

申請手順

ステップ内容
STEP 1システム改修の実施および費用の支払い
STEP 2必要書類(領収書、内訳書、ベンダー記入のチェックシート)の準備
STEP 3「医療機関等向け総合ポータルサイト」より電子申請(申請期間: 2025年6月6日~2026年1月15日)
STEP 4社会保険診療報酬支払基金による審査後、補助金振込

補助金額・補助率

本補助金は、医療機関の種別や改修内容によって補助上限額および補助率が異なります。詳細は以下の通りです。

病院の場合

改修内容補助上限額補助率
① 医療費助成のオンライン資格確認のみ28.3万円事業費56.6万円を上限に1/2
② 医療費助成+マイナ診察券(再来受付機改修なし)28.3万円事業費56.6万円を上限に1/2
③ 医療費助成+マイナ診察券(再来受付機改修あり)60.0万円事業費120万円を上限に1/2
④ マイナ診察券のみ(再来受付機改修なし)28.3万円事業費56.6万円を上限に1/2
⑤ マイナ診察券のみ(再来受付機改修あり)60.0万円事業費120万円を上限に1/2

診療所の場合

改修内容補助上限額補助率
① 医療費助成のオンライン資格確認のみ5.4万円事業費7.3万円を上限に3/4
② 医療費助成+マイナ診察券5.4万円事業費7.3万円を上限に3/4
③ マイナ診察券のみ5.4万円事業費7.3万円を上限に3/4

薬局の場合

事業者区分補助上限額補助率
大型チェーン薬局以外5.4万円事業費7.3万円を上限に3/4
大型チェーン薬局3.6万円事業費7.3万円を上限に1/2

計算例(診療所の場合): システム改修の事業費が7.3万円の場合 → 7.3万円 × 補助率3/4 = 5.475万円。千円未満は切り捨てのため、補助額は5.4万円となります。

対象者・申請要件

対象となる事業者

  • 日本国内に所在する保険医療機関・保険薬局(病院、診療所、薬局)
  • 医療費助成のオンライン資格確認またはマイナ診察券の導入を目的として、対象となるシステム改修を実施する事業者
  • 申請期間内に、指定された方法で申請手続きを完了できる事業者

主な要件

  • 申請は1医療機関・薬局につき1回限りです。医療費助成とマイナ診察券の改修を別時期に行った場合でも、申請は一括で行う必要があります。
  • 2024年度(令和6年度)に実施したシステム改修も補助対象となります。
  • 予算の範囲内で実施されるため、申請期間内であっても受付が終了する可能性があります。

補助対象経費

経費区分詳細対象可否
レセコン等改修費医療費助成の受給者証情報をオンラインで取得するため、またはマイナ診察券で受付を行うためのレセプトコンピュータ等の改修費用
再来受付機改修費等【病院のみ】マイナ診察券に対応するための再来受付機の改修費用、または購入時のオプション費用
ハードウェア購入費PC、サーバー、ネットワーク機器等の購入費用(改修に伴わない汎用的なものは対象外)×
保守・運用費用システム改修後の保守契約料や通信費等のランニングコスト×

重要: 本補助金は、2024年度(令和6年度)に実施した改修費用も対象となる事後申請が可能です。申請には支払いを証明する領収書等が必要となります。

必要書類一覧

No.書類名備考
1領収書システム改修費用の支払いを証明するもの
2領収書内訳書費用の詳細がわかるもの
3システム改修に係るチェックシートシステムベンダーに記入を依頼

審査基準・採択のポイント

本補助金は、事業計画の優劣を競うものではなく、要件を満たした申請に対して交付されるものです。したがって、採択に向けて最も重要なのは、申請要件を正確に理解し、不備のない書類を期間内に提出することです。

申請における重要ポイント

  • 早期の申請: 補助金は国の予算の範囲内で実施されるため、申請期間の終了を待たずに受付が締め切られる可能性があります。改修が完了次第、速やかに申請手続きを行うことを推奨します。
  • 申請は一括で: 医療費助成とマイナ診察券の改修を異なるタイミングで行った場合でも、補助金の申請はまとめて1回で行う必要があります。複数回に分けての申請は認められないため注意が必要です。
  • 書類の正確性: 領収書やチェックシートなど、提出書類に不備があると審査が遅れたり、交付が認められない場合があります。特にベンダーに記入を依頼する書類は、内容を十分に確認してください。

よくある質問

Q1: 2024年度(令和6年度)に行った改修は対象になりますか?

A: はい、対象となります。2024年度に実施し、支払いが完了しているシステム改修についても、本補助金の申請が可能です。

Q2: 申請から補助金交付までどのくらいかかりますか?

A: 申請後の審査期間について、公式サイトでは明記されていません。申請件数により変動する可能性がありますが、一般的に数ヶ月程度を要する場合があります。

Q3: 医療費助成の改修と、マイナ診察券の改修を別々に行いました。申請も別々に行えますか?

A: いいえ、できません。改修を別々の機会に実施した場合でも、補助金の申請は一括で行う必要があります。一体的な申請手続きが求められており、複数回の申請は認められません。

Q4: 申請書の書き方や制度について、どこに問い合わせればよいですか?

A: 「オンライン資格確認等コールセンター」が専門の問い合わせ窓口として設置されています。申請方法や制度の詳細について不明な点があれば、こちらにご確認ください。

制度の概要・背景

本補助金は、政府が推進する「医療DX」の一環として、厚生労働省が実施する支援制度です。「医療DXの推進に関する工程表」(令和5年6月2日医療DX推進本部決定)に基づき、医療費助成(公費負担医療や地方単独医療費助成)におけるオンライン資格確認の導入を促進することを目的としています。

この仕組みが普及することにより、医療機関・薬局では受付時の資格確認作業が効率化され、医療事務のコスト削減につながります。また、患者はマイナンバーカード1枚で医療保険と医療費助成の資格情報を提示できるようになり、利便性が大幅に向上します。令和7年5月時点で全国183の自治体(22都府県、161市町村)で運用が開始されており、今後さらなる拡大が見込まれています。

まとめ・お問い合わせ先

「医療費助成のオンライン資格確認に係るシステム改修補助金」は、医療DXを推進し、業務効率化と患者の利便性向上を実現するための重要な支援策です。2024年度の改修も対象となるため、既に対応済みの医療機関・薬局も申請が可能です。予算には限りがあるため、対象となる事業者は早めの申請をご検討ください。

お問い合わせ先

窓口名称: オンライン資格確認等コールセンター
電話: 0800-080-4583(通話無料)
受付時間: 月曜日~金曜日 8:00~18:00(祝日除く)、土曜日 8:00~16:00(祝日除く)
申請サイト: 医療機関等向け総合ポータルサイト
公式サイト: 厚生労働省ホームページ

申請前チェックリスト

0 / 5 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
医療費助成のオンライン資格確認を導入するため、またはマイナンバーカードを診察券として利用するためにレセプトコンピュータ等のシステム改修を行う病院、診療所、薬局。
必須 対象経費に該当する事業である
・医療費助成の受給者証情報をオンラインで取得するためのレセプトコンピュータ(レセコン)の改修費用 ・マイナンバーカードを診察券として利用するためのレセコン等の改修費用 ・【病院のみ】マイナ診察券に対応するための再来受付機の改修費用または購入時のオプション費用
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2026年1月15日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
・領収書 ・領収書内訳書 ・システム改修に係るチェックシート(システムベンダーが記入)
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です

類似補助金との比較

採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
比較項目
この補助金 厚生労働省(助成実施:社会保険診療報酬支払基金)
【2025年】大阪府宿泊税システム改修費補助金|最... 大阪府 府民文化部 都市魅力創造局 企画・観光課
【2025年度】宮城県・仙台市 宿泊税レジシステム... 宮城県、仙台市
【2025年】医療機関等生産性向上支援事業|最大1... 新潟県
【2025年】兵庫県医療機関向け生産性向上支援事業...
【2025年福井県】社会福祉施設・医療機関向け省エ... 福井県(福井県社会福祉施設・医療機関等省エネ設備支援事業事務局)
補助金額最大60万円最大50万円(客室数による)最大150万円最大18万円/施設、許可病床数×4万円(病院、有床診療所)要確認1事業あたり上限200万円、下限20万円
補助率【病院】対象経費の1/2(上限28.3万円または60万円) 【診療所】対象経費の3/4(上限5.4万円) 【薬局(大型チェーン以外)】対象経費の3/4(上限5.4万円) 【薬局(大型チェーン)】対象経費の1/2(上限3.6万円)補助対象経費の2分の1以内。補助上限額は1施設あたりの客室数に応じて5万円から50万円まで変動します。補助対象経費の10分の10。1施設あたり上限150万円。150万円を超える申請については、事前に整備内容について協議が必要です。病院・有床診療所:許可病床数×4万円 無床診療所・訪問看護ステーション:1施設×18万円消費税別の補助対象経費に対し1/2以内
申請締切2026年1月15日令和8年2月28日(土曜日)まで令和8年1月30日令和8年2月27日(金曜日)随時令和7年6月2日(月)から令和7年10月31日(金)まで
難易度
採択率 AI推定 30.0% ※参考値 85.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値 30.0% ※参考値
準備目安約14日約14日約14日約14日約14日約14日
詳細詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →

よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
医療費助成のオンライン資格確認を導入するため、またはマイナンバーカードを診察券として利用するためにレセプトコンピュータ等のシステム改修を行う病院、診療所、薬局。
Q 申請に必要な書類は何ですか?
・領収書
・領収書内訳書
・システム改修に係るチェックシート(システムベンダーが記入)
Q どのような経費が対象になりますか?
・医療費助成の受給者証情報をオンラインで取得するためのレセプトコンピュータ(レセコン)の改修費用
・マイナンバーカードを診察券として利用するためのレセコン等の改修費用
・【病院のみ】マイナ診察券に対応するための再来受付機の改修費用または購入時のオプション費用
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

CONTACT
補助金図鑑 #137831
2026年版
情報ソース
厚生労働省(助成実施:社会保険診療報酬支払基金)
2025年11月18日 確認済み

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