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【全国】自治体・事業者向け最大50億円!バイオマス・脱炭素補助金の申請ガイド(2025年)

3秒でわかる要点
令和6年度補正および令和7年度予算案のバイオマス利活用・脱炭素支援策を解説。環境省の地域脱炭素推進交付金(最大50億円)や総務省のローカル10,000プロジェクトなど、自治体・事業者が活用可能な多省庁の補助金メニュー、採択率を高める申請のステップ、FAQを網羅した申請ガイドです。
約13分で読了 49回閲覧 2025年12月31日最新情報

補助金詳細

01
確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大50.0億円
最大支給額
2025年3月31日
申請期限
普通
申請難易度

対象者

主催機関
環境省、農林水産省、経済産業省、総務省等
対象地域
全国
対象事業者
地方自治体、民間事業者、大学、国立研究開発法人等

申請要件

● 対象経費
  • 施設整備費、設備導入費、調査設計費、研究開発費等(運営費は対象外)
● 必要書類
事業計画書、収支予算書、地域金融機関の融資証明、自治体との連携確認書類等
補助率
採択率 40.0%
Section 02

補助金概要

Overview
この補助金に関する詳細な説明と申請に必要な情報を掲載しています。最新情報は公式サイトで必ずご確認ください。

令和6年度補正予算および令和7年度予算案に基づき、バイオマスの利活用と地域脱炭素化を推進するための大規模な支援策が発表されました。本制度は、自治体や民間事業者が連携して取り組む地域資源循環プロジェクトに対し、特定地域では最大50億円規模の交付金が用意されるなど、過去最大級の支援体制が整えられています。地域経済の活性化とカーボンニュートラルの同時実現を目指す方にとって、極めて重要な申請機会となります。

この記事でわかること

  • 省庁を横断したバイオマス利活用支援策の全体像
  • 地域脱炭素推進交付金(最大50億円)の申請要件と詳細
  • ローカル10,000プロジェクトを活用した初期投資費用の助成
  • 施設整備から研究開発まで多岐にわたる支援類型の選択方法

バイオマス利活用支援策の全体像と予算規模

令和7年度の予算案および令和6年度補正予算では、環境省、農林水産省、経済産業省、文部科学省、国土交通省、総務省、内閣府の7府省が連携し、バイオマスの産業利用やエネルギー化を強力にバックアップしています。この支援策は、家畜排せつ物、食品廃棄物、木質バイオマス、下水汚泥など、地域の未利用資源を価値あるエネルギーや製品に転換することを目的としています。

特定地域脱炭素移行加速化交付金

最大 50億円

ローカル10,000プロジェクト予算総額

約 26.7億円

多岐にわたる対象バイオマス資源

今回の支援策が対象とする資源は、従来の木質チップ等に限らず、地域に存在する多様なバイオマスをカバーしています。

資源カテゴリー 具体例
農畜産系 家畜排せつ物、稲わら、もみ殻(農作物非食用部)
森林・産業系 木質バイオマス、食品廃棄物、竹
都市インフラ系 下水汚泥、微細藻類、プラスチック代替素材

注目すべき主要支援プログラムの詳細

1. 地域脱炭素推進交付金(環境省)

地域全体で再エネ・省エネ・蓄エネを推進するための、今回最も規模の大きい交付金制度です。

ここがポイント:最大50億円の支援

『特定地域脱炭素移行加速化交付金』では、民間裨益型の自営線マイクログリッド事業等に対し、原則2/3の補助率で最大50億円の支援が受けられます。脱炭素先行地域への採択と組み合わせることで、地域経済の基盤を抜本的に強化することが可能です。

2. ローカル10,000プロジェクト(総務省)

地域の資源と資金を活用した『地域密着型事業』の立ち上げを支援する制度です。地域金融機関からの融資を前提としており、官民金が一体となった事業構築が求められます。

  • 補助率:原則1/2以内(条件不利地域やデジタル技術活用、脱炭素関連事業、女性・若者活躍関連は3/4まで引き上げ)
  • 支援内容:事業化段階で必要となる初期投資費用
  • 実施主体:民間事業者(市区町村が国へ申請)

3. 研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)(文部科学省/JST)

大学等の研究シーズを社会実装に繋げるための強力なハンズオン支援プログラムです。

支援ステージ 支援上限額 形式
育成フェーズ 1,500万円/年 グラント(委託)
本格フェーズ 2,500万円/年 マッチングファンド
実装支援 総額 5億円 返済型(成功時のみ)

事業成功のための申請戦略と注意点

重要:申請時のチェックポイント

  • 地域経済への波及効果:単なる設備導入ではなく、地域の雇用や資金循環にどう貢献するかを数値化して示す必要があります。
  • 金融機関の早期巻き込み:ローカル10,000プロジェクトのように、融資が前提となる事業では、計画段階からの金融機関との合意形成が不可欠です。
  • 重複申請の回避:同一の経費に対して複数の補助金を受けることはできません。事業の性質に最も合った制度を慎重に選択してください。

専門家活用のメリット

官公庁の補助金、特にバイオマス関連は技術的・経済的要件が非常に高度です。総務省の『GXアドバイザー』派遣制度などを活用し、外部の専門知見を取り入れることで、採択率の大幅な向上と事業計画の精緻化が期待できます。

補助金申請までの5ステップ

1
リソース・課題の棚卸し
地域に存在するバイオマス資源の種類や量、解決すべき地域の課題を明確にします。
2
公募要領の精読とマッチング
今回紹介した多数の支援策の中から、自社のプロジェクトに最適な補助金・交付金を選定します。
3
ステークホルダーとの合意形成
自治体、地域金融機関、連携企業との協議を行い、実行力のある協力体制を構築します。
4
事業計画書の策定
脱炭素効果(CO2削減量)や投資収益性、地域への貢献度をロジカルに記述した計画書を作成します。
5
申請書類の提出と審査
期限内に必要書類を不備なく提出します。多くの場合、電子申請システム(jGrants等)が利用されます。

よくある質問(FAQ)

Q

民間企業単独での申請は可能ですか?

事業により異なります。ローカル10,000プロジェクトのように自治体を通じた申請が必須のものもあれば、A-STEPのように民間企業が直接提案できるものもあります。ただし、地域資源の活用を掲げる以上、自治体との連携は採択への強力なプラス要因となります。

Q

補助金の対象となる経費にはどのようなものがありますか?

主に施設整備費(プラント建設、プラットフォーム設置)、設備導入費(発電機、熱交換器、収集車両)、および一部の調査設計費・研究開発費が対象です。運営に係る人件費や消耗品費は対象外となるケースが多いため注意が必要です。

Q

複数の省庁の補助金を組み合わせて使うことはできますか?

一般的に、同一のプロジェクト内の同一経費に対して、国庫を財源とする複数の補助金を二重に受け取ることはできません。ただし、事業を工程ごとに切り分け、フェーズ1(調査)は環境省、フェーズ2(施設整備)は農水省といった形で別々に申請することは、計画の整合性が取れていれば可能な場合があります。

Q

採択された後の実績報告は大変ですか?

国費を扱うため、支出の証憑(領収書や契約書)管理は非常に厳格です。定期的な進捗報告と、事業完了後の実績報告書の提出が義務付けられており、事務負担は相応に大きいと想定しておくべきです。事務局とのコミュニケーションを密に取ることがスムーズな完了のコツです。

Q

予算案の状態でも申請準備を始めて良いですか?

はい、強く推奨します。補正予算や次年度予算は国会成立後に速やかに公募が開始されます。公募期間は1ヶ月〜1.5ヶ月程度と短いことが多いため、予算案が公表された現時点から、関係各所との調整や計画策定を開始しなければ間に合いません。

バイオマスの利活用は、日本の脱炭素化と地方創生を繋ぐ鍵となります。令和7年度に向けて提示されたこれらの支援策は、多省庁が連携することで、川上から川下までを隙間なくカバーする体制を構築しています。最大50億円規模の交付金をはじめとする今回の好機を逃さず、持続可能な地域社会の構築に向けた一歩を踏み出してください。申請に関する最新情報は、各省庁の公式サイトおよび公募要領にて逐次更新されるため、定期的な確認が不可欠です。

まずは最寄りの自治体または経済局へご相談を

大規模なプロジェクトほど、早期の相談が採択への近道です。各省庁の地方局や、地域金融機関の担当者へ事業構想を伝え、制度の適性を確認しましょう。

免責事項: 本記事の情報は令和7年2月時点の予算案および補正予算データに基づくものです。今後、国会での予算成立や法律の改正、社会情勢の変化に応じて、事業内容、予算額、公募時期等が変更される場合があります。実際の申請にあたっては、必ず各府省庁が発行する最新の公募要領をご確認ください。

03

申請前チェックリスト

0 / 5 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
地方自治体、民間事業者、大学、国立研究開発法人等
必須 対象経費に該当する事業である
施設整備費、設備導入費、調査設計費、研究開発費等(運営費は対象外)
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2025年3月31日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
事業計画書、収支予算書、地域金融機関の融資証明、自治体との連携確認書類等
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です
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類似補助金との比較

採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
比較項目
この補助金 環境省、農林水産省、経済産業省、総務省等
【中部地方】EV・充電設備導入に最大150万円!自... 中部地方各自治体(福井県・石川県・富山県・新潟県等)
【2025年】令和7年度 浪江町次世代自動車購入補... 福島県浪江町
補助金額 最大50.0億円 最大150万円最大30万円(FCV)
補助率
申請締切 2025年3月31日 令和8年3月末日まで(予算に達し次第終了)令和8年3月13日まで
難易度
採択率 AI推定 40.0% ※参考値 80.0% ※参考値 100.0% ※参考値
準備目安 約14日 約14日約14日
詳細 詳細を見る →詳細を見る →
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よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
地方自治体、民間事業者、大学、国立研究開発法人等
Q 申請に必要な書類は何ですか?
事業計画書、収支予算書、地域金融機関の融資証明、自治体との連携確認書類等
Q どのような経費が対象になりますか?
施設整備費、設備導入費、調査設計費、研究開発費等(運営費は対象外)
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

CONTACT
補助金図鑑 #155459
2026年版
情報ソース
環境省、農林水産省、経済産業省、総務省等
2025年12月31日 確認済み

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