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事業承継・M&Aの補助金まとめ【2026年版】|類型別の選び方と一覧

事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討する中小企業・個人事業主・後継者

この記事の結論

対象者事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討する中小企業・個人事業主…
補助額・給付額最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度(補助率 国の制度:1/2〜2/3(枠により異なる)/自治体の制度:1/2〜定額(制度による))
申請時期公募要領・公式情報をご確認ください
まずやること公式ページで最新情報・対象条件を確認
補助金の概要 対象・上限額・申請期限・関連制度を確認

事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討する中小企業・個人事業主…

対象地域
全国
対象者
事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討する中小企業…
補助上限
最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度
補助率・給付条件
国の制度:1/2〜2/3(枠により異なる)/自治体の制度:1/2〜定額(制度による)
公募期間
国:十五次公募 2026年6月19日〜7月24日17時(次回公募は要確認)/自治体:随時〜年1回(制度による)
実施機関
中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村
申請方法
オンライン申請
  • 最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度まで補助される制度です
  • 中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村が公募する公的支援制度
  • 申請方法はオンライン申請に対応
  • 専門家への無料相談に対応しています

詳細解説

重要ポイント(結論)

事業承継・M&Aの補助金は「国の事業承継・M&A補助金」と「都道府県・市区町村の独自制度」の2階層で考える

国の制度は2026年7月時点の十五次公募で事業承継促進枠(最大800万円)・専門家活用枠(最大600万円、特例で最大2,000万円)・PMI推進枠・廃業/再チャレンジ枠(150万〜300万円)の4枠構成。都道府県・市区町村は上限5万〜600万円程度の独自補助金を多数用意しており、両者は原則併用できる。

事業承継・M&A補助金の全体像

事業承継・M&A補助金 申請の一般的な流れ5ステップ
事業承継・M&A補助金 申請の一般的な流れ(計画策定→専門家相談→申請→交付決定→事業実施・報告)

後継者不在や第三者承継(M&A)の増加を受け、事業承継まわりの補助金は「国が全国一律で実施する制度」と「都道府県・市区町村が地域事情に合わせて設計する制度」の二層構造になっている。国の制度は専門家費用(仲介手数料・デューデリジェンス費用等)や設備投資、廃業費用など経費の性質ごとに枠が分かれており、自治体の制度は承継後の店舗改修費や相談費用の一部補助など、より実務に近い経費を対象にすることが多い。

専門家

「事業承継補助金」と検索すると国の制度と自治体の制度が入り混じって出てきますが、対象経費と申請窓口が別物です。まず自社の所在地の自治体制度を確認し、そのうえで国の専門家活用枠を検討するのが遠回りに見えて実は近道です。

読者

国と自治体の補助金は同時に申請してもいいんですか?

TL;DR — 5秒でわかるまとめ

  1. 事業承継・M&Aの補助金は「国の事業承継・M&A補助金」と「都道府県・市区町村の独自制度」の2階層がある
  2. 国の制度は事業承継促進枠(最大800万円)・専門家活用枠(最大600万円、特例2,000万円)・PMI推進枠・廃業/再チャレンジ枠(150万〜300万円)の4枠構成(2026年7月・十五次公募時点)
  3. 都道府県・市区町村の制度は上限5万〜600万円程度と幅が広く、地域の後継者不在対策として設計されている
  4. 国と自治体の制度は原則併用可能だが、対象経費が重複する場合は片方しか使えないケースがある
  5. 迷ったら公的窓口「事業承継・引継ぎ支援センター」への無料相談が最初の一歩になる
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4枠国の補助金の枠数(十五次公募)
最大2,000万円専門家活用枠・特例上限

目的別・タイプ別の選び方

事業承継・M&A関連補助金の上限額比較棒グラフ
代表制度の補助上限額比較(国4枠・都道府県例・市区町村例/2026年7月時点)

どの枠・どの制度を使うべきかは「承継のどの段階で」「何にお金がかかるか」で決まる。まず自社の状況がどのタイプに近いかを次の表で確認する。

やりたいこと代表的な制度補助上限額主な対象者
承継後の設備投資・販路開拓事業承継・M&A補助金(事業承継促進枠)800万円親族内・第三者承継後に投資を行う中小企業
M&Aの仲介手数料・DD費用(買い手)事業承継・M&A補助金(専門家活用枠・買い手支援類型)600万円(特例2,000万円)他社を譲り受ける中小企業
小規模M&Aの仲介手数料(売り手)専門家活用枠・小規模売り手支援類型150万円小規模事業者で会社・事業を譲渡する側
廃業して新事業に再挑戦廃業・再チャレンジ枠150万〜300万円廃業費用が発生する事業者
都道府県独自の承継支援を使いたい都道府県の事業承継補助金(例:東京都)200万〜600万円程度都道府県内の中小企業・個人事業主
市区町村独自の承継支援を使いたい市区町村の事業承継補助金(例:別府市)5万〜300万円程度対象市区町村内の事業者

全国どこでも申請できる「事業承継・M&A補助金」(旧称:事業承継・引継ぎ補助金)。十五次公募(2026年7月24日締切)では事業承継促進枠・専門家活用枠・PMI推進枠・廃業/再チャレンジ枠の4枠が公募中。次回公募の日程は公式サイトで要確認。

都道府県が独自に実施。東京都の事業承継補助金北海道の事業承継支援策など、専門家活用費や設備投資費を対象にするケースが多い。公募時期は自治体ごとに異なる。

市区町村が独自に実施。別府市の事業承継支援補助金川越市の事業承継店舗改修等補助金など、店舗改修費や相談費用への補助が中心。上限額は数万円〜300万円程度と自治体差が大きい。

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対象者・対象事業

対象地域(全国)

目的
事業承継
対象地域
全国
対象者
事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討する中小企業・個人事業主・後継者
補助上限
最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度
難易度
中級

詳細条件・対象自治体は公募要領をご確認ください。

【国の制度】主要な事業承継・M&A補助金

国の事業承継・M&A補助金(旧:事業承継・引継ぎ補助金)に関連する記事を集約する。公募回によって名称・枠構成が変わるため、各記事の受付状況を必ず確認すること。

関連する補助金・助成金

【都道府県の制度】都道府県の事業承継補助金

Q

都道府県の補助金と市区町村の補助金は同時に使えますか?

A

制度によります。同一経費への二重補助は不可が原則で、対象経費が異なれば併用できることが多い。申請前に両方の窓口へ確認するのが確実。

【市区町村の制度】市区町村の事業承継支援補助金

店舗改修費や相談費用、第三者承継のマッチング費用など、より実務に近い経費を対象にする制度が中心。上限額は自治体の予算規模により数万円〜300万円程度と幅がある。

第三者承継・診療所承継など特化型の制度

医院・診療所の開業承継や、災害からの事業再建にともなう第三者承継など、業種・状況が限定された特化型の制度もある。

事業承継・M&A補助金でよくある失敗・不採択になる落とし穴

審査に落ちる、あるいは交付後に経費が対象外と判定される事業者には共通のやりがちな失敗パターンがある。次の4点は特に見落としが多い注意点。

  1. 交付決定前の契約・発注承継契約や専門家との契約を採択・交付決定前に締結すると、その経費は対象外になる。「早く進めたい」気持ちが不採択・減額の最大の原因になりやすい。
  2. 経営力向上計画など認定書類の準備不足事業承継促進枠は経営力向上計画等の認定が申請要件になることがあり、準備不足のまま申請すると不採択になりやすい。逆算したスケジュール管理が必須。
  3. 対象経費の見落とし仲介手数料以外にもデューデリジェンス費用や表明保証保険料が対象になる場合があるが、見落として過少に申請してしまうケースが目立つ。公募要領の経費区分を必ず確認する。
  4. 自治体制度との併用ルール確認不足都道府県・市区町村の制度は国の制度と対象経費が重複すると対象外となる場合がある。確認不足のまま両方に申請し、交付後に返還を求められる注意すべき事例もある。

国の制度と自治体の制度を比較

国の制度と自治体の制度の使い分け併用イメージ図
国の制度と自治体の制度は原則併用可能だが、対象経費が重複する場合は二重補助不可
比較軸国の事業承継・M&A補助金都道府県・市区町村の制度
補助上限額150万〜800万円(特例で最大2,000万円)5万〜600万円程度(制度による)
補助率1/2〜2/3(枠により異なる)1/2〜定額(制度による)
主な対象経費仲介手数料・DD費用・設備投資・廃業費用等店舗改修費・相談費用・設備費等(制度による)
併用可否自治体制度と原則併用可(国の他制度との重複は不可)国の制度と原則併用可(自治体内の類似制度は不可の場合あり)
公募頻度年2〜4回程度(次回公募日程は要確認)随時〜年1回(自治体による)

専門家活用枠(買い手支援)

他社を譲り受ける側の仲介手数料・DD費用等を補助。通常上限600万円、100億企業宣言特例で最大2,000万円。

専門家活用枠(小規模売り手支援)

2026年の十五次公募で新設。小規模事業者が会社・事業を譲渡する際の仲介手数料等を補助率2/3・上限150万円で支援。

実額シミュレーション:小規模M&Aの補助額早見表

小規模事業者が専門家活用枠(小規模売り手支援類型)を使い、仲介手数料300万円(税別)でM&Aによる譲渡を行うモデルケースで試算する。上限額まで満額支給されるとは限らない点に注意。

項目内容備考
仲介手数料(税別)300万円モデルケースの想定額
補助率2/3小規模売り手支援類型
計算上の補助額200万円300万円×2/3
補助上限額150万円小規模売り手支援類型の上限
実際の交付見込額150万円(上限適用)審査結果により減額される場合あり

よくある質問

Q

個人事業主でも事業承継・M&A補助金を申請できますか?

A

可能。中小企業基本法上の中小企業者に該当する個人事業主も対象で、実際に多くの自治体制度は個人事業主向けの枠を設けている。

Q

国の補助金と都道府県の補助金、どちらを先に申請すべきですか?

A

決まった順序はないが、都道府県・市区町村の制度は公募期間が短く随時締切のものが多いため、まず地元の制度の締切を確認し、並行して国の公募スケジュールを追うのが実務的。

Q

M&Aの専門家(仲介会社)はどこに相談すればいいですか?

A

公的な相談窓口として事業承継・引継ぎ支援センター(都道府県ごとに設置)が無料相談を受け付けている。民間M&A仲介会社を使う場合も、事前にセンターで基本方針を相談しておくと補助金の対象要件を満たしやすい。

Q

廃業してから新しい事業を始める場合も補助金の対象になりますか?

A

対象になる。廃業・再チャレンジ枠は廃業費用(在庫廃棄費・解体費・原状回復費等)を補助率1/2〜2/3・上限150万〜300万円で支援しており、事業承継促進枠や専門家活用枠と併用できる場合がある。

Q

採択されなかった場合、再チャレンジできますか?

A

可能。国の制度は年複数回の公募があり、次回公募での再申請ができる。不採択理由が経費区分の誤りや書類不備であることも多いため、事業承継・引継ぎ支援センター等に事前確認してから再申請するのが有効。

最終更新:2026年7月14日/本記事は令和8年度(2026年度)の公募情報を基に作成しています。制度は年度・公募回によって内容が変更されるため、申請前に必ず最新の公募要領を確認してください。

出典

補助金の概要

要点

対象・申請情報まとめ

詳細条件は公募要領で確認してください。

対象地域
全国
対象者
事業承継(親族内・第三者承継)やM&Aを検討…
補助上限
最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度
公募期間
国:十五次公募 2026年6月19日〜7月24日17時(次回公募は要確認)/自治体:随時〜年1回(制度による) 常時受付 / 要確認
実施機関
中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村
主要スケジュール
申請期間 国:十五次公募 2026年6月19日〜7月24日17時(次回公募は要確認)/自治体:随時〜年1回(制度による) 全スケジュール ›
申請方法
オンライン申請 公式申請ページへ
  • 最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度まで補助される制度です
  • 中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村が公募する公的支援制度
  • 申請方法はオンライン申請に対応
  • 専門家への無料相談に対応しています
POINT!

この補助金のポイント

  • 最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度まで補助される制度です
  • 中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村が公募する公的支援制度
  • 申請方法はオンライン申請に対応
  • 専門家への無料相談に対応しています
公募期間 国:十五次公募 2026年6月19日〜7月24日17時(次回公募は要確認)/自治体:随時〜年1回(制度による) 常時受付 / 要確認
実施機関中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村
主要スケジュール
  1. 申請期間国:十五次公募 2026年6月19日〜7月24日17時(次回公募は要確認)/自治体:随時〜年1回(制度による)
全スケジュール ›
申請方法 オンライン申請 公式申請ページへ
公募要領
SUMMARY

この補助金のまとめ

  • 最大2,000万円(国:専門家活用枠・特例)/自治体は制度により5万〜1,000万円程度まで補助される制度です
  • 中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村が公募する公的支援制度
  • 申請方法はオンライン申請に対応
  • 専門家への無料相談に対応しています
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中小企業診断士・社会保険労務士 監修体制

公開日: 最終更新日: 出典: 中小企業庁・事業承継、引継ぎ支援センター・各都道府県・市区町村

本記事は一般的な情報提供を目的としています。補助額・対象要件・募集状況は変更される場合があるため、申請前に必ず各実施機関の公募要領・公式情報をご確認ください。