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【東京都】難病指定医の医療機関向け最大5万円!東京都臨床調査個人票電子化等推進事業補助金の申請ガイド(2025年)

3秒でわかる要点
東京都内の難病指定医が勤務する医療機関を対象に、臨床調査個人票のオンライン化に必要なPC購入や環境整備費を最大5万円(補助率1/2)補助する令和7年度事業の申請ガイド。J-Grantsでの申請締切は2025年10月31日。対象者、対象経費、申請ステップ、注意点を専門家が詳しく解説します。
約14分で読了 18回閲覧 2025年12月27日最新情報

補助金詳細

01
確認要件
制度・対象の確認
申請対象
会社規模・事業内容
申請書類
計画書の作成・準備
申請・審査
結果通知・交付
最大5万円
最大支給額
2025年10月31日
申請期限
普通
申請難易度

対象者

主催機関
東京都保健医療局
対象地域
東京都
対象事業者
都内の難病指定医等が勤務する病院・診療所

申請要件

● 対象経費
  • パソコン購入費、周辺機器、インターネット敷設工事費、システム改修費
● 必要書類
交付申請書、所要額調書、内訳書、見積書等、GビズID
補助率
採択率 90.0%
Section 02

補助金概要

Overview
この補助金に関する詳細な説明と申請に必要な情報を掲載しています。最新情報は公式サイトで必ずご確認ください。

東京都では、難病医療費助成事務の効率化を図るため、臨床調査個人票のオンライン化を推進しています。本事業は、都内の難病指定医が勤務する医療機関を対象に、オンライン登録システムへの対応に必要なパソコン購入やインターネット環境整備等の経費を最大5万円まで補助するものです。申請期限が2025年10月31日までと短いため、早めの準備が推奨されます。

この記事でわかること

  • 補助金の対象となる医療機関の具体的な要件
  • パソコン購入や回線工事など補助対象となる経費の詳細
  • J-Grantsを利用した電子申請の手順とスケジュール
  • 不採択や返還を防ぐための重要事項と留意点
  • 実績報告から補助金入金までの具体的な流れ

東京都臨床調査個人票電子化等推進事業補助金の概要

現在、国は医療機関、自治体、国が共通のデータベースを構築することで、難病および小児慢性特定疾病の診断書(臨床調査個人票・意見書)のオンライン化を強力に推進しています。この流れを受け、東京都は都内の医療機関が円滑にオンライン登録システムへ移行できるよう、環境整備に係る経費の支援を行っています。

補助対象となる医療機関の条件

本補助金の対象となるのは、以下の要件をすべて満たす医療機関です。

  • 難病の患者に対する医療等に関する法律に基づき規定された『難病指定医』または『協力難病指定医』が勤務していること。
  • 医療法に基づき許可を受けた東京都内の病院、または届出を行った診療所であること。
  • 過去に同一の補助金(本推進事業補助金)を受給していないこと。
  • 東京都小児慢性特定疾病医療費意見書オンライン登録システム環境整備事業費補助金と重複申請していないこと。

重複申請に関する注意点

  • 小児慢性特定疾病のオンライン化支援(別事業)との併用はできません。どちらか一方の申請に絞る必要がありますので、医療機関の実情に合わせて選択してください。
  • 過去に本補助金を受けた実績がある場合、今回新たにパソコンを買い替えるなどの目的で再申請することは認められません。

補助金額と対象経費の詳細

本補助金は、臨床調査個人票のオンライン登録を実現するための『初期投資』を支援する性格が強いものです。継続的な運用費ではなく、導入にかかる直接的な経費が対象となります。

補助上限額

5万円

補助率

1/2

経費区分 具体的な内容例
設備費 臨床調査個人票オンライン登録用のパソコン(PC)、周辺機器の購入費用。
工事費 インターネット回線の新規敷設工事費、院内LANの整備費用。
システム改修費 既存の電子カルテシステム等をオンライン登録システムと連携させるための改修費用。

補助対象外となるケース

  • 交付決定通知が届く前に、契約・発注・納品・支払いを行った経費。
  • 一般的な事務用ソフトのライセンス料や保守点検費用。
  • インターネットの月額利用料金(通信料)。

申請から受給までの5ステップ

本補助金の申請は、政府の補助金電子申請システム『J-Grants』を通じて行います。従来の郵送申請とは異なる準備が必要です。

1
事前準備:GビズIDの取得と見積書の作成
J-Grantsの利用には『GビズIDプライム』アカウントが必要です。取得に2〜3週間かかる場合があるため、未取得の場合は早急に申請してください。また、導入予定のPCや工事費の見積書を取得します。
2
交付申請:J-Grantsよりデータ送信
2025年9月1日から10月31日までの期間内に、必要書類(所要額調書、内訳書等)をJ-Grants上にアップロードして申請します。書類の不備があると差し戻されるため、形式チェックを念入りに行いましょう。
3
交付決定と事業実施
東京都から『補助金交付決定通知書』が届いた後(11月〜12月予定)、PCの購入や工事の契約を行います。この『通知後』に発注することが必須条件です。支払いは銀行振込など証跡が残る形で行ってください。
4
実績報告:支払証明の提出
事業完了後、2026年3月31日までに実績報告書をJ-Grantsで提出します。領収書、納品書、契約書の写しが必要です。実績額が0円になった場合でも、交付決定を受けている場合は報告が必須となります。
5
補助金額の確定と入金
東京都が実績を審査し、問題がなければ『補助金交付額確定通知書』が送付されます。入金は2026年5月頃を予定しています。その後、必要に応じて令和9年までに消費税仕入控除税額の報告を行います。

採択率を高める申請のコツと注意点

本補助金は要件を満たせば高い確率で交付されますが、事務的な不備で不採択となる医療機関が散見されます。特に以下の3点に留意してください。

1. 指定医の資格確認を徹底する

補助対象の根幹は『難病指定医が勤務していること』です。申請書に記載する指定医の氏名や登録番号が最新かつ正確であることを確認してください。人事異動等で指定医が不在となっている期間に購入したものは対象外となるリスクがあります。

2. 『交付決定前』の支出は1円も認められない

多くの方が陥りやすい失敗パターンです。J-Grantsで申請しただけでは『交付決定』ではありません。東京都からの通知書を確認する前に、家電量販店でPCを購入したり、回線工事を完了させてしまったりすると、その経費は一切補助されません。スケジュールには余裕を持ってください。

3. 見積書の有効期限に注意

申請時に提出する見積書の有効期限が、交付決定予定時期までカバーされているか確認してください。PCなどは価格変動が激しいため、有効期限切れの見積書は再取得を求められることがあります。

よくある質問(FAQ)

Q

複数のパソコンを購入した場合、すべて補助対象になりますか?

基準額は1医療機関あたり10万円(補助上限5万円)です。この範囲内であれば複数台の合算も可能ですが、あくまで『臨床調査個人票のオンライン登録に必要』と認められる範囲内に限られます。一般的な事務用PCを大量に購入することは認められません。

Q

タブレット端末は補助対象に含まれますか?

オンライン登録システムの利用が可能であれば対象となる場合があります。ただし、OSのバージョンやブラウザ環境がシステムの推奨仕様を満たしている必要があります。申請前にシステムの動作環境をご確認ください。

Q

昨年度に申請しそびれたのですが、今年度の申請は可能ですか?

はい、令和7年度の公募期間内に申請可能です。ただし、購入時期が令和7年度の交付決定以降である必要があります。過去に購入済みのものに対して遡及して申請することはできません。

Q

J-Grants以外の申請方法(郵送など)はありますか?

原則としてJ-Grantsを通じた電子申請となります。インターネット環境がない等の特別な事情がある場合は、東京都の担当窓口へ事前に相談することをお勧めしますが、行政DXの観点から電子申請が強く推奨されています。

Q

補助金を受け取った後、何か義務はありますか?

主な義務は2点です。(1)実績報告の提出、(2)消費税仕入控除税額の報告(該当する場合)です。また、補助金で購入した備品は一定期間、適切に管理・保管する義務があります(財産処分の制限)。

本補助金は、東京都内の難病指定医療機関にとって、デジタル化への一歩を踏み出す貴重な支援策です。上限5万円という金額は小規模に思えるかもしれませんが、臨床調査個人票のオンライン化は患者様の利便性向上と事務負担軽減に直結します。申請期限である10月31日を逃さないよう、まずはGビズIDの確認と見積書の取得から始めてください。

補助金申請の不明点は専門家へ

J-Grantsの操作方法や対象経費の判断に迷う場合は、東京都の担当部署または補助金申請支援の専門家への相談をご検討ください。確実な受給のために、早めの行動が鍵となります。

免責事項: 本記事の情報は作成時点(2025年9月)のものです。補助金の内容やスケジュールは変更される場合がありますので、申請前に必ず東京都保健医療局の公式サイトで最新の公募要領をご確認ください。

03

申請前チェックリスト

0 / 6 完了 0%
申請資格
必須 対象者の要件を満たしている
都内の難病指定医等が勤務する病院・診療所
必須 対象地域に該当する
対象: 東京都
必須 対象経費に該当する事業である
パソコン購入費、周辺機器、インターネット敷設工事費、システム改修費
スケジュール
必須 申請期限内である
締切: 2025年10月31日
書類準備
必須 事業計画書を作成できる
必須 必要書類を準備できる
交付申請書、所要額調書、内訳書、見積書等、GビズID
チェックを入れて申請可否を確認しましょう
必須項目をすべてクリアすると申請可能です
05

類似補助金との比較

採択率について:比較表内の採択率はAIによる推定値であり、公式発表の数値ではありません。補助金選びの参考としてご活用ください。
比較項目
この補助金 東京都保健医療局
【大阪市】障がい児通所支援事業者向け最大560万円... 大阪市
【摂津市】障害児福祉サービス事業所向け最大10万円... 摂津市 こども政策課
【神奈川・福岡・山形他】医療機関向け最大4万円/病... 各都道府県(健康医療局・保健医療部等)
【全国】医療機関向け最大1,114万円!医療施設経... 厚生労働省および各都道府県(保健医療局等)
補助金額 最大5万円 最大560万円最大10万円最大4万円(1病床あたり)または18万円/施設最大1,114万円(加算時)
補助率
申請締切 2025年10月31日 令和8年2月20日まで令和8年1月20日まで(最終期限3月31日)自治体により異なる(令和7年12月から令和8年2月等)自治体により異なる(多くは令和7年度末まで)
難易度
採択率 AI推定 90.0% ※参考値 80.0% ※参考値 90.0% ※参考値 90.0% ※参考値 60.0% ※参考値
準備目安 約14日 約14日約14日約14日約14日
詳細 詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →詳細を見る →
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よくある質問

Q この補助金の対象者は誰ですか?
都内の難病指定医等が勤務する病院・診療所
Q 申請に必要な書類は何ですか?
交付申請書、所要額調書、内訳書、見積書等、GビズID
Q どのような経費が対象になりますか?
パソコン購入費、周辺機器、インターネット敷設工事費、システム改修費
Q 申請から採択までどのくらいかかりますか?
通常、申請から採択決定まで1〜2ヶ月程度かかります。

お問い合わせ

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補助金図鑑 #154692
2026年版
情報ソース
東京都保健医療局
2025年12月27日 確認済み
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