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対象地域(東京都)
地域要件
東京都
上記の地域が対象となります
都内在住の不登校の小・中学生を持つ保護者。東京都が認定するフリースクール等の通所型施設を月1日以上利用している家庭。所得制限なし。入会金・施設維持費・教材費は対象外。
| 補助上限額 | 月額最大20,000円 |
|---|---|
| 補助率 | 月額上限20,000円(利用料に充当)。四半期ごとに指定口座へ振込。入会金・教材費・施設維持費は対象外。 |
| 申請難易度 | 中級 |
※詳細条件・上限の内訳は公募要領をご確認ください。
対象・申請情報まとめ
詳細条件は公募要領で確認してください。
この補助金のポイント
| 公募期間 | 2026/5/27〜2027/2/12 締切まで 252日 |
|---|---|
| 実施機関 | 東京都生活文化局 私学部連携支援課 |
| 主要スケジュール |
|
| 申請方法 | オンライン・郵送併用 公式申請ページへ |
| 必要書類 | ①交付申請書(公式サイトまたは事務局から入手)②在学・在籍証明書(通学校が発行)… 詳細を見る › |
| 公募要領 |
44,979円/月
東京都の平均月謝(2024年度調査)
最大2万円/月
都助成金(所得制限なし)
最大4万円/月
都+区の合算助成(一部地域)
| 制度名 | 東京都フリースクール等利用者支援事業助成金 |
|---|---|
| 所管機関 | 東京都生活文化局 私学部連携支援課(TEL: 03-5388-3154) |
| 対象者 | 都内在住の不登校の小・中学生の保護者(所得制限なし) |
| 助成額 | 月額上限20,000円(入会金・教材費・施設維持費は対象外) |
| 申請受付期間 | 2026年5月27日〜2027年2月12日(2026年4月分より遡及可) |
| 申請方法 | オンライン(公式サイトでログイン登録後)または郵送 |
| 支給サイクル | 四半期ごとに指定口座へ振込 |
| 問い合わせ先 | 事務局(アデコ株式会社受託)TEL: 03-6800-8763(9:00〜18:00、日祝除く) |

東京都教育委員会の2024年度調査によると、フリースクール等を利用する保護者が実際に支払っている費用の平均は月額44,979円です。全国平均(文部科学省調査:約33,000円)を約36%上回っており、東京都内の施設運営コスト・人件費の高さが影響しています。費用の幅は広く、通所型・オンライン型・居場所型など施設の形態によって月2万円台から月10万円超まで差があります。約60%の保護者が「家計への負担感がある」と回答しており、助成制度の活用が家庭の選択肢を守る上で重要です。
入学金の相場は平均5.3万円(0円〜10万円以上)で、別途教材費・交通費・活動費などが加わります。年間総費用は通所日数・施設規模によって50万〜100万円超になることも珍しくありません。都の助成金(月最大2万円)を12カ月フルに受給できれば年間最大24万円が補填され、家計負担を実質20,979円/月まで圧縮できる計算です(平均月謝44,979円の場合)。さらに住んでいる区市町村によっては上乗せ助成で負担をさらに減らせます。

東京都が認定する施設一覧(公式サイト掲載)でフリースクールが対象かどうかを確認します。認定外施設への利用料は助成対象外となり不採用になります。施設側に認定取得の有無を確認するのが最初のステップです。
tokyo-fs-support.metro.tokyo.lg.jp にアクセスしてユーザー登録(メールアドレス必須)。郵送申請の場合は事務局(TEL: 03-6800-8763)へ申請書類を請求してください。
在学・在籍証明書、利用料の領収書(月別)、施設発行の利用実績証明書などを準備して申請。2026年4月分まで遡及可能ですが、書類不備での差し戻しを防ぐため施設側に「助成金用」と依頼して書式を整えてもらいましょう。
交付決定後は3カ月ごとに利用実績報告書を提出します。報告書の提出漏れが差し戻しや支給停止の最も多い原因です。カレンダーにリマインダーを設定しておくことを強く推奨します。
報告内容確認後、指定口座に振り込まれます。月額上限2万円×通所月数が最大受給額です(概算)。年間最大24万円。


※補助上限・算出方法は令和8年度公募要領に基づく概算です。実際の支給額は申請内容の審査によります。

文部科学省の2023年度調査では、全国の不登校小中学生数が約34万6千人に達し、過去最多を更新しています。東京都内だけでも数万人規模とされ、フリースクールの需要は急拡大しています。こうした背景を受け、東京都は令和6年(2024年)7月から利用者への助成制度を開始しました。令和8年度版では申請期間が延長され、より多くの家庭が活用しやすい仕組みに改善されています。
一方、フリースクール等の事業者向けには別途「東京都フリースクール等支援事業」(常勤職員人件費の補助率3/4・上限150万円)もあります。保護者側の利用料助成と施設側の運営補助を両輪とした重層的な支援体制が整備されており、不登校の子どもが安心して通える選択肢を広げることが目的です。フリースクールの費用面で迷っている家庭は、ぜひ令和8年度の助成制度を早めに確認することをお勧めします。

以下は申請において最も多い不採用・不採択パターンを 5 つ紹介します。申請前に確認し、失敗を防ぎましょう。
| 自治体 | 都の助成(月額) | 上乗せ助成(月額) | 合算最大(月額) |
|---|---|---|---|
| 東京都(全域共通) | 最大20,000円 | — | 20,000円 |
| 荒川区・品川区・足立区 | 最大20,000円 | +20,000円 | 40,000円 |
| 北区・葛飾区 | 最大20,000円 | +10,000円 | 30,000円 |
| 港区 | 最大20,000円 | +4,750円 | 24,750円 |
※上乗せ助成は各区市町村への別途申請が必要です。対象条件・申請期間が都制度と異なる場合があります。最新情報は各区市町村の公式サイトをご確認ください。令和8年度は変更の可能性があります。
前年度の制度概要と申請実績。令和8年度との変更点も解説しています。
高校・専修学校の授業料を軽減する都の制度。フリースクールを経て進学後に活用できます。
フリースクール費用を補填するために活用できる関連制度・助成金をまとめました。
後日の問い合わせや区市町村上乗せ助成の申請に必要です。紙・デジタル両方で保管しておきましょう。
報告漏れが最も多い差し戻し・支給停止の原因です。スマホのカレンダーに繰り返しアラームを設定することを強く推奨します。
荒川区・品川区・足立区等では月最大2万円の上乗せ助成があります。各区の教育委員会または子ども支援窓口に問い合わせてください。
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公開日: 最終更新日: 出典: 東京都生活文化局 私学部連携支援課