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この記事の結論
対象者農業法人・JA・農業者組織・認定農業者等を対象に、産地基幹施設(集出…
補助額・給付額最大20億円(整備事業)/ 最大5,000万円(推進事業)(補助率 整備事業1/2以内。推進事業は定額。食料システム構築支援タイプは別途公募要領で確認。)
申請時期募集中(締切まで3日)
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補助金の概要
要点
対象・申請情報まとめ
詳細条件は公募要領で確認してください。
- 対象地域
- 全国
- 対象者
- 農業法人・JA・農業者組織・認定農業者等を対…
- 補助上限
- 最大20億円(整備事業)/ 最大5,000万円(推進事業)
- 公募期間
- 2026/1/27〜2/3(第1回)、2026/4/14〜4/28(第2回・食料システム構築タイプ)、〜2026/6/30(産地基幹施設タイプ・都道府県経由) 締切まで 3日
- 実施機関
- 農林水産省
- 主要スケジュール
- 申請期間 2026/1/27〜2/3(第1回)、2026/4/14〜4/28(第2回・食料システム構築タイプ)、〜2026/6/30(産地基幹施設タイプ・都道府県経由) 全スケジュール ›
- 申請方法
- オンライン・郵送併用 公式申請ページへ
- 必要書類
- ①事業申請書(所定様式・タイプ別に異… 詳細を見る ›
- 公募要領
- PDF 公募要領(公式)
- 最大20億円(整備事業)/ 最大5,000万円(推進事業)まで補助される制度です
- 農林水産省が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン・郵送併用に対応
- 専門家への無料相談に対応しています
POINT!
この補助金のポイント
- 最大20億円(整備事業)/ 最大5,000万円(推進事業)まで補助される制度です
- 農林水産省が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン・郵送併用に対応
- 専門家への無料相談に対応しています
| 公募期間 | 2026/1/27〜2/3(第1回)、2026/4/14〜4/28(第2回・食料システム構築タイプ)、〜2026/6/30(産地基幹施設タイプ・都道府県経由) 締切まで 3日 |
|---|---|
| 実施機関 | 農林水産省 |
| 主要スケジュール |
|
| 申請方法 | オンライン・郵送併用 公式申請ページへ |
| 必要書類 | ①事業申請書(所定様式・タイプ別に異なる)②事業実施主体計画書(推進事業・整備事… 詳細を見る › |
| 公募要領 |
詳細解説
農業法人・JA・農業者組織が集出荷施設等の整備費を最大20億円・補助率1/2で受け取れる「強い農業づくり総合支援交付金」。令和8年度は産地基幹施設等支援タイプの都道府県経由受付が2026年6月30日(火)締切で迫っている。申請書の書き方を一か所でも誤ると書類不備で差し戻しとなるため、タイプ別の記入ポイントと採択のコツを本稿で解説する。
TL;DR:この記事でわかること5点
- タイプ別(産地基幹施設・生産事業モデル・食料システム構築)で申請先と様式が異なる
- 申請書に必須の5書類と各記入項目の具体的なポイント
- 費用対効果分析書の書き方で採択率が大きく変わる理由
- 不採択・差し戻しになるNG事例5パターンと対策
- 令和8年度産地基幹施設等支援タイプの締切は2026年6月30日(都道府県経由)
最大補助額(整備事業)
20億円
補助率1/2以内
最大補助額(推進事業)
5,000万円
定額補助
産地基幹施設タイプ締切
2026/6/30
都道府県経由申請


制度概要:強い農業づくり総合支援交付金とは?いくら・いつまで申請できるか
制度の基本情報を下表にまとめた。申請方法や締切はタイプによって異なるため、まず自社の取組がどのタイプに当たるかを確認することが書き方の第一歩だ。
| 制度名 | 強い農業づくり総合支援交付金 |
|---|---|
| 所管 | 農林水産省(生産局農業生産支援課) |
| 対象者 | 農業法人・JA・農業者組織・認定農業者等 |
| 補助率 | 整備事業:1/2以内 / 推進事業:定額 |
| 最大補助額 | 整備事業:最大20億円 / 推進事業:最大5,000万円 |
| 申請方法 | 農林水産省共通申請サービス(e-Gov)または郵送 |
| 令和8年度スケジュール | 第1回:2026/1/27〜2/3 / 第2回:2026/4/14〜4/28(食料システム構築タイプ) / 産地基幹施設タイプ:〜2026/6/30(都道府県経由) |
| 地域 | 全国(都道府県・農林水産省への申請先はタイプ別に異なる) |
| 問い合わせ | 最寄りの地方農政局 / 各都道府県農政担当部局 |
申請書の書き方:5ステップで準備する方法といつから動くべきか
申請書類の準備は提出締切の3カ月前から開始するのが理想。以下のステップで進めると書き漏れや差し戻しを防げる。
- タイプを選択し申請先を確認する — 産地基幹施設等支援タイプは都道府県農政部局経由、食料システム構築支援タイプ(全国)は農林水産省生産局へ直接提出。公募要領で自社取組のタイプを確認し、様式をダウンロードする。
- 事前相談(締切の2〜3カ月前) — 都道府県窓口への事前相談は必須。採択に必要な「成果目標」の設定方法・事業計画の方向性を担当者に確認する。この段階で書き方の基本方針が決まる。
- 事業実施主体計画書を作成する — 推進事業・整備事業の計画書を作成。整備事業では設計図面・見積書(3社見積推奨)を添付する。費用が適正かを裏付けることが採択のコツだ。
- 費用対効果分析書を作成する(採択の最重要ポイント) — 審査の配点が最も高いのがこの書類。「成果目標ポイント」が高い順に採択されるため、売上増加額・雇用創出数・省力化率を具体的な数値で明示し、根拠資料を添付する。
- チェックリストで書類を確認し提出 — 事業申請書・事業実施主体計画・費用対効果分析・環境負荷低減チェックシートの4点を揃え、e-Govまたは郵送で提出。提出後の修正は原則不可のため最終確認を怠らない。
背景:なぜ申請書の書き方が採否を決めるのか
強い農業づくり総合支援交付金の審査は「対象施設を決めて補助するのではなく、成果目標に対するポイントが高い順に採択される目標達成型」である。そのため申請書の記入内容—特に費用対効果分析書の成果目標の数値設定—が採択率を大きく左右する。農林水産省が公開する優良事例集でも、採択された事業者は事前相談を経て成果目標を具体的・定量的に設定している点が共通している。
令和8年度は食料安全保障の強化を背景に、生産基盤の強靱化・流通効率化・スマート農業対応の取組に予算が重点配分されている。申請書でこれらのキーワードと結びつけた事業計画を書くことが、採択のコツとなる。
補助金額シミュレーター(産地基幹施設等支援タイプ・補助率1/2)
対象事業費を入力すると補助金の概算額を計算します。令和8年度公募要領準拠の概算です。実際の金額は採択審査・確定検査で決定します。
採択されない 5 つの落とし穴と申請書差し戻し対策
注意点として最も多い不採用パターンを 5 つ紹介。申請書を提出する前に確認したい失敗例だ。
- 費用対効果分析書の数値根拠が不十分で差し戻し — 最も多いNG事例がこれ。「売上○○円増加」「雇用○名確保」の数値を裏付ける根拠資料がない状態で提出すると、差し戻しまたは不採択になる典型的な失敗だ。
- 申請書タイプの選択ミスで不採択 — 整備内容に対してタイプを間違えると書類不備として落ちる。事前相談なしに申請した場合に多い失敗例。都道府県窓口で事前確認を。
- 成果目標ポイントが低い計画で不採用 — 目標達成型の審査のため、ポイント設定が競合より低いと採択されない。定性的な表現だけで数値がないのが不採択の典型パターン。
- 見積書・設計図の記載不備で差し戻し — 整備事業では3社見積が推奨されるが、見積書に必要事項(品番・数量・単価)が記載されていない落とし穴が多い。
- 締切直前に事前相談なしで提出→失敗 — 窓口に相談せず締切直前に提出した場合、補正対応の時間がなく不採用になるリスクが高い。早期に動くことが採択のコツ。
申請書が差し戻しになる主な原因:この状態では提出しないこと
- 費用対効果分析書に具体的な数値根拠がない(NG事例最多)
- 整備費が5,000万円未満で産地基幹施設タイプに申請(不採択の典型)
- 環境負荷低減クロスコンプライアンスチェックシートが未添付
- 申請先(都道府県経由 vs 農林水産省直接)を間違える

関連制度・後継制度との比較:どれがいくら・いつまで申請できるか
関連内部リンク:農業支援補助金の対象・金額・申請方法を比較
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以下の比較表で、農業系補助金の主要4制度の補助率・金額・対象をひと目で確認できる。
| 制度名 | 補助率 | 最大補助額 | 対象・特徴 |
|---|---|---|---|
| 強い農業づくり総合支援交付金 | 1/2以内 | 最大20億円(整備事業) | 農業法人・JA・農業者組織。産地基幹施設整備が主対象 |
| 農地利用効率化等支援交付金 | 定額 | 最大600万円〜1,500万円 | 認定農業者・担い手農家。農地集積・機械導入支援 |
| 産地生産基盤パワーアップ事業 | 1/2以内 | 最大1億円超(事業による) | 農業法人・生産者組織。省力化・加工・流通対応の取組 |
| 農業構造転換支援事業 | 定額・1/2 | 最大20億円 | 農業法人の経営転換支援。新基本計画実施関連取組 |
| 愛知県農業機械補助金(強い農業づくり交付金) | 1/3〜1/2 | 最大3,000万円 | 愛知県内農業者。農業機械・施設整備(都道府県単独) |
申請後アクション:交付決定から実績報告までの流れ
- 交付決定通知の受領と着手確認 — 採択発表後、都道府県または農林水産省から交付決定通知を受領する。通知前に事業着手すると補助対象外となるため通知後に開始する。
- 事業の実施と中間報告(必要な場合) — 事業計画に基づき施設整備・推進事業を実施。進捗状況の報告義務がある場合は期限を厳守し、変更が生じる場合は事前に担当窓口へ報告する。
- 実績報告書の提出と確定検査 — 事業完了後に実績報告書・支出証拠書類・成果目標の達成状況を提出。確定検査を経て補助金額が精算される。実績報告は年度末(3月31日)が期限になることが多い。
出典
SUMMARY
この補助金のまとめ
- 最大20億円(整備事業)/ 最大5,000万円(推進事業)まで補助される制度です
- 農林水産省が公募する公的支援制度
- 申請方法はオンライン・郵送併用に対応
- 専門家への無料相談に対応しています
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よくある質問
すべての質問を見るタイプによって申請先と様式が異なります。産地基幹施設等支援タイプは都道府県の農政担当部局の様式、食料システム構築支援タイプ(全国)は農林水産省の公募要領に添付の様式を使用します。まず公募要領を入手して様式を確認してください。
費用対効果分析書には「成果目標」を数値で記入します。例:「10年後の売上を○○億円から○○億円へ増加(○○%増)」「雇用○名確保」「出荷量○トン増加」などです。数値の根拠として販路確保の証明書類や経営状況データを添付すると採択率が上がります。
タイプによって異なります。食料システム構築支援タイプ(全国)の2回目公募は2026年4月28日で終了しています。産地基幹施設等支援タイプは都道府県経由で2026年6月30日が締切です。次年度(令和9年度)の公募は例年1〜2月頃に開始されます。
産地基幹施設等支援タイプへの個人申請は原則として難しく、農業法人・JA・農業者組織が主な対象です。個人で農業機械・施設の補助を受けたい場合は農地利用効率化等支援交付金(認定農業者向け)や都道府県の農業機械補助金をご検討ください。
農林水産省の「強い農業づくりの支援」ページ(maff.go.jp)に公募要領と様式が掲載されています。都道府県の農政担当部局でも様式・記入例の入手と窓口相談が可能です。農林水産省の優良事例集(事例資料PDF)も採択事例の参考になります。
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編集: 補助金図鑑 編集部
中小企業診断士・社会保険労務士 監修体制
本記事は一般的な情報提供を目的としています。補助額・対象要件・募集状況は変更される場合があるため、申請前に必ず各実施機関の公募要領・公式情報をご確認ください。